指数加权集成深度学习用于肺腺癌组织学生长模式分类
指数加权集成深度学习模型在肺腺癌组织学生长模式分类中达到kappa值0.9648和96.52%准确率，显著优于最佳单模型（McNemar检验p<10^-12）。
肿瘤
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第 61–80 条 · 共 237 条medRxiv Oncology精选评分3737 Cancer Cell精选评分5050 MXD4依赖性增殖暂停是脑转移癌细胞的脆弱性靶点
脑转移定植癌细胞利用MXD4依赖性增殖暂停在应激条件下存活，为后续转移灶生长做准备。该暂停通过抑制MYC并激活保护性应激反应实现，但也构成了可靶向的阿喀琉斯之踵。靶向这一机制有望在临床复发前根除微转移灶。
bioRxiv Cancer Biology精选评分5656 单细胞多组学空间分析揭示管腔型乳腺癌ctDNA释放异质性
研究开发了scMASTER方法整合单细胞转录组、突变、空间转录组和匹配肿瘤血浆DNA测序，在10例非转移性HR+/HER2-乳腺癌患者中发现8种恶性上皮状态具有不同的ctDNA释放潜力。
bioRxiv Cancer Biology精选评分5454 整合免疫肽组与转录组揭示髓母细胞瘤中癌症限制性非经典HLA I类配体组
研究在21例人髓母细胞瘤样本中鉴定出2298个非经典HLA I类结合肽，其中598个为癌症限制性ncHLAp（CR ncHLAp）。这些CR ncHLAp主要来源于非经典翻译来源，70%可结合患者匹配的HLA等位基因，87%具有免疫原性潜力，可能成为髓母细胞瘤T细胞免疫治疗的候选靶点。
推荐理由：研究通过整合免疫肽组和转录组数据，在髓母细胞瘤中识别出598个癌症限制性非经典HLA I类配体，为T细胞免疫治疗提供了新靶点。
Nature Genetics精选评分5959 胚系同源重组缺陷影响TP53突变克隆造血在铂类和PARP抑制剂治疗中的适应性
研究表明铂类比PARP抑制剂更能驱动DNA损伤反应基因突变的克隆造血，而存在胚系同源重组缺陷突变会降低这些克隆的扩增速率。该研究发表于Nature Genetics，DOI:10.1038/s41588-026-02752-2。
推荐理由：研究比较了铂类和PARP抑制剂对DNA损伤反应基因突变克隆造血的影响，并发现胚系同源重组缺陷突变会减缓这些克隆的扩增速度。
bioRxiv Cancer Biology精选评分6262 BLTP3A功能失调通过STING释放溶酶体应激诱导的抗肿瘤免疫
研究发现BLTP3A是卵巢癌中溶酶体应激的解决因子，其功能缺失或M1098T变异会增强溶酶体损伤，从而持续激活STING通路并促进IFN-λ产生，重塑抗肿瘤免疫微环境。携带M1098T变异的患者总生存期更长，肿瘤中细胞毒性T细胞-髓系细胞区域富集。机制上，BLTP3A功能障碍破坏了CASM相关的溶酶体应激解决，导致STING信号持续而不增加cGAMP。
推荐理由：研究揭示了BLTP3A功能缺失通过STING通路增强抗肿瘤免疫的机制，为卵巢癌治疗提供了潜在靶点。
bioRxiv Cancer Biology精选评分6969 碱基编辑器扫描绘制MAPK信号通路的化学-遗传相互作用图谱
研究应用碱基编辑器扫描22个MAPK通路基因，构建了信号通路的化学-遗传相互作用图谱。分析发现耐药突变常出现在非直接药物靶点的蛋白中，并识别出KRAS N端的一个变构位点。研究还发现催化功能受损的CRAF突变体对结构相似的MEK抑制剂产生双向耐药和增敏作用。
bioRxiv Cancer Biology精选评分6161 靶向抑制性中性粒细胞的染色质脆弱性可恢复抗肿瘤免疫
研究发现肿瘤诱导的抑制性中性粒细胞依赖mSWI/SNF染色质重塑维持其病理状态。两种口服mSWI/SNF ATP酶拮抗剂（降解剂和催化抑制剂）在PD-1阻断耐药的同系肿瘤模型中实现免疫依赖性肿瘤控制，并增强检查点疗法疗效。
推荐理由：研究揭示了抑制性中性粒细胞依赖的染色质可塑性靶点，并展示了两种口服小分子在PD-1耐药模型中的协同潜力。
bioRxiv Cancer Biology精选评分5858 空间转录组学揭示导管原位癌微环境与侵袭性乳腺癌复发的关联
研究对49例原发性导管原位癌标本进行空间转录组学分析，发现肿瘤近端区域TREM2+巨噬细胞和肌成纤维样癌相关成纤维细胞富集，且TREM2+巨噬细胞丰度与后续侵袭性乳腺癌复发相关。配体-受体对分析识别出GRN-SORT1、SPP1-CD44和LGALS9-CD44等潜在的空间信号交互，并通过多重免疫染色在蛋白水平验证了这些发现。
推荐理由：研究通过空间转录组学揭示了导管原位癌中TREM2+巨噬细胞与侵袭性复发风险的关联，为开发预后标志物提供了线索。
bioRxiv Cancer Biology精选评分6060 LENTRA平台通过系统性肿瘤细胞重编程将实体瘤转化为原位免疫治疗生物工厂
LENTRA是一种抗原靶向慢病毒平台，可在体内选择性转导并遗传修饰肿瘤细胞，使其在肿瘤局部产生免疫检查点抑制剂、细胞因子或治疗性酶。在多种小鼠实体瘤模型中，局部产生抗CTLA-4或IL-12引发了强效抗肿瘤反应并避免了全身毒性。
bioRxiv Cancer Biology精选评分6161 谷氨酰胺与GLS1是限制头颈鳞癌T细胞浸润和功能的关键代谢检查点
一项前瞻性研究发现头颈鳞癌（HNSCC）中肿瘤代谢重编程导致谷氨酰胺剥夺和谷氨酰胺酶-1（GLS1）高表达，这限制了T细胞向肿瘤的迁移并削弱其功能。药理学抑制或基因敲除GLS1可增强肿瘤对免疫细胞介导的细胞毒性和免疫检查点抑制剂的敏感性，其机制涉及破坏谷胱甘肽依赖的ROS防御、抑制肿瘤增殖和增加MHC表达。
medRxiv Oncology精选评分4646 FRANK：一种采用数据高效学习的泛癌种儿童肿瘤 RNA-seq 分类器
FRANK 机器学习模型利用 11,467 个转录组数据对 181 种儿童肿瘤及正常组织类型进行分类，在包含 16,398 个样本的九个数据集中实现 98.3% 的总体准确率。该模型在长读长 RNA 测序数据以及噪声和低质量数据中保持准确性，并在外部数据集上优于其他已发表的儿童泛癌种 RNA-seq 分类器。
bioRxiv Genomics精选评分5454 靶向CRISPRi筛选揭示胶质母细胞瘤对RNA聚合酶III转录组扰动具有耐受性
研究者开发了可诱导的CRISPR干扰平台和定制sgRNA文库，用于特异性靶向RNA聚合酶III（Pol III）转录的基因及其核心组件。全基因组筛选在二倍体成纤维细胞和HEK293T细胞中发现了多个Pol III依赖性，但胶质母细胞瘤模型对单个Pol III基因和核心组件的抑制均表现出不敏感，尽管靶点抑制有效。
推荐理由：研究通过CRISPRi筛选发现胶质母细胞瘤对RNA聚合酶III转录组的扰动具有耐受性，为理解该癌症类型的代谢可塑性提供了线索。
The Lancet Oncology精选评分6969 Iberdomide 联合达雷妥尤单抗和地塞米松 vs 达雷妥尤单抗、硼替佐米和地塞米松治疗复发难治多发性骨髓瘤的 3 期试验结果
Iberdomide 联合达雷妥尤单抗和地塞米松相比达雷妥尤单抗、硼替佐米和地塞米松显著提高了 MRD 阴性完全缓解率。最常见 3-4 级不良事件为血液学事件和感染，多数可通过标准支持治疗管理。这些结果支持该方案作为复发难治多发性骨髓瘤的有效治疗选择，且有望在不同诊疗场景中实施。
推荐理由：试验直接比较了含 iberdomide 的新方案与标准方案在 MRD 阴性完全缓解率上的差异，为复发难治骨髓瘤提供了潜在门诊适用方案。
BioSpace精选评分5353 强生与传奇生物公布 Carvykti 在多发性骨髓瘤中的长期生存获益
CARTITUDE-2 研究队列 A 的 60.7 个月中位随访数据显示，Carvykti 使半数多发性骨髓瘤患者存活且无疾病进展。该队列包含 20 名既往接受过至少一线治疗的患者，此时总生存率为 69.2%。自上次数据分析以来新增两例死亡，一例因疾病进展，一例因新发乳腺癌，发言人称均与 Carvykti 无关。
推荐理由：长期随访数据提供了该疗法在特定患者群体中的持久疗效证据，并与历史数据形成对比。
BioSpace精选评分3737 基因泰克与 AI 生物技术公司 Earendil 达成超 15 亿美元双特异性抗体癌症疗法合作
基因泰克支付 5500 万美元首付款，与 AI 生物技术公司 Earendil Labs 合作发现和开发多款双特异性抗体癌症疗法。这笔交易总额可能超过 15 亿美元，包含开发、监管和销售里程碑付款。Earendil 将负责抗体发现和早期临床研究，而基因泰克将主导后续全球临床开发和商业化活动。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6464 传奇生物CARVYKTI在CARTITUDE-2队列A中显示50% RRMM患者单次输注五年后无进展生存
传奇生物公布CARVYKTI（西达基奥仑赛）在CARTITUDE-2队列A（n=20）的五年随访数据，中位随访60.7个月。结果显示，50%（10/20）的复发/难治性多发性骨髓瘤患者在单次输注后未接受维持治疗仍保持存活且无疾病进展。
推荐理由：单次输注后五年随访数据为评估CAR-T疗法在RRMM中的长期疗效提供了关键证据。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6060 Cell研究提出铜死亡执行蛋白新机制，为耐药胃癌和肝癌提供干预思路
Cell研究提出铜死亡执行蛋白新机制，为耐药胃癌和肝癌提供干预思路。铜死亡是铜依赖性细胞死亡方式，此前已知铜离子载体可诱导线粒体脂酰化蛋白聚集并破坏铁硫簇蛋白，但缺乏真正意义上的执行蛋白。
medRxiv Oncology精选评分5656 MIST3 二期试验显示 AXL 和 PD1 联合抑制在间皮瘤中疾病控制率达 46.2%
MIST3（NCT03654833）二期试验评估 bemcentinib（AXL 抑制剂）和 pembrolizumab（PD1 抑制剂）联合治疗 ICB 初治复发间皮瘤患者，达到主要终点，12 周疾病控制率为 46.2%（90% CI 29.2–63.8%）。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6565 沈柏用/Florent Ginhoux团队揭示组织驻留巨噬细胞通过构建硒保护生态位维持胰腺癌侵袭性
研究发现富集于肿瘤边界的组织驻留巨噬细胞能够向高侵袭性的胰腺导管腺癌细胞提供硒蛋白Selenop，协助其逃避铁死亡并维持侵袭状态。这一发现揭示了免疫细胞作为营养和代谢物质供体，直接维持恶性肿瘤细胞特定侵袭状态的新肿瘤微环境代谢支持模式。
推荐理由：该研究揭示了巨噬细胞通过提供硒蛋白支持肿瘤细胞抵抗铁死亡的新机制，为理解肿瘤微环境的代谢支持功能提供了新视角。