该研究通过冷冻电镜解析了 IS621 桥联重组酶与切除 DNA 底物复合体的结构，发现切除底物呈线性 X 形构象而插入底物为 U 形，这种构象差异解释了插入效率天然高于切除的结构基础。bRNA 中被命名为 handshake guides 的双核苷酸与顶链的配对同样调节两种反应效率，研究为桥联编辑应用的最优设计提供方向性依据。
推荐理由：该研究解析了 IS621 切除复合体冷冻电镜结构并解释了插入效率天然高于切除的结构基础，可为桥联编辑工具的底物设计提供机理对照。
Liu 等鉴定出在定型红系细胞中沉默胚胎 ζ-globin 基因的顺式调控元件，并据此设计的基因编辑策略可在小鼠和人类 α-地中海贫血疾病模型中将 ζ-globin 表达重新激活至治疗相关水平。DOI：10.1038/s41588-026-02770-0。
推荐理由：顺式调控元件的鉴定为缺乏成熟治疗手段的重型 α-地中海贫血提供了一条重新激活内源基因的编辑路径。
Nature 回顾了从 1990 年代 OTOF 基因发现到 2025 年 Otarmeni 成为首个获 FDA 批准用于听力丧失基因疗法的关键里程碑。CHORD 试验中 80% 的参与者在 24 周内听力改善，42% 恢复听力。文章详述了病毒载体 Anc80L65 克服基因尺寸难题、小鼠模型验证机制以及多国药企布局此领域的研发转折点。
推荐理由：文章通过时间线梳理了从基础研究到临床获批的关键节点，帮助读者理解基因疗法开发中的技术障碍与突破路径。
系统发育和同线性分析揭示了脊椎动物 Prox 基因家族的进化史，表明有颌脊椎动物的最后共同祖先已存在 2-3 个 Prox 亚家族。研究发现了 Prox2 和 Prox3 基因在特定脊椎动物谱系中存在多次独立丢失事件，并找到了祖先脊椎动物基因组中存在第四个 Prox 基因随后丢失的证据。
研究人员开发了可通过单次 AAV 递送的光开关 Cas12f 系统，结合聚焦超声实现深部组织基因编辑的远程激活，无需手术或植入设备即可精确控制编辑的时空特异性。
推荐理由：通过聚焦超声实现深部组织基因编辑的非侵入性控制，为体内基因治疗提供了新的操作范式。
作者更正了2022年发表于《自然-生物技术》的文章中图5b第“52”行存在重复小鼠图像的错误。该图的HTML和PDF版本现均已修正。
研究表明铂类比PARP抑制剂更能驱动DNA损伤反应基因突变的克隆造血，而存在胚系同源重组缺陷突变会降低这些克隆的扩增速率。该研究发表于Nature Genetics，DOI:10.1038/s41588-026-02752-2。
推荐理由：研究比较了铂类和PARP抑制剂对DNA损伤反应基因突变克隆造血的影响，并发现胚系同源重组缺陷突变会减缓这些克隆的扩增速度。
适配大RNA载荷和组织靶向的脂质纳米颗粒（LNP）可增强体内基因组编辑效率。该递送系统通过优化LNP拓扑结构和脂质组分，解决了大尺寸基因组编辑工具（如碱基编辑器和先导编辑器）的体内递送挑战。这一进展为基于CRISPR的疗法提供了非病毒递送平台。
筛选离子化脂质发现LC-1能形成增强内体逃逸的结构，解决了脂质纳米颗粒递送大尺寸基因编辑器mRNA时效率低下的问题。LC-1脂质纳米颗粒可在小鼠肝脏、肺和大脑中实现高效的基因组编辑。该研究为设计大载荷基因治疗递送系统提供了新策略。
研究者开发了可诱导的CRISPR干扰平台和定制sgRNA文库，用于特异性靶向RNA聚合酶III（Pol III）转录的基因及其核心组件。全基因组筛选在二倍体成纤维细胞和HEK293T细胞中发现了多个Pol III依赖性，但胶质母细胞瘤模型对单个Pol III基因和核心组件的抑制均表现出不敏感，尽管靶点抑制有效。
推荐理由：研究通过CRISPRi筛选发现胶质母细胞瘤对RNA聚合酶III转录组的扰动具有耐受性，为理解该癌症类型的代谢可塑性提供了线索。
研究界已识别出多种复杂的癌症基因组突变模式，包括染色体碎裂、染色质环化、kataegis以及APOBEC酶介导的突变簇。这些模式由不同的分子机制驱动，例如DNA修复错误、染色体分离异常以及APOBEC3A等酶在治疗压力下的活性。理解这些突变特征对于阐明癌症的演化机制和耐药性的产生至关重要。
研究发现 BC200 基因逃逸至一种人痘病毒，揭示了该基因在灵长类动物中的持续转座活动。该研究发表于 Science 期刊第 393 卷第 6818 期。
对包括三种非吸血蚊子在内的七个物种进行基因组和全脑图谱比较分析，揭示了与吸血行为丢失相关的趋同基因缺失。这些缺失涉及唾液血小板聚集抑制剂Aegyptin、血液激活丝氨酸蛋白酶以及两个与血液成分味觉检测相关的离子型受体分支。非吸血雌蚊的触角叶体积更小，表明其嗅觉输入减少，这些发现为解析复杂吸血性状的遗传基础提供了进化切入点。
逆转录转座子可通过一种不依赖典型包膜蛋白的机制感染邻近细胞。该机制利用一种小型类融合蛋白介导细胞间的直接传播。这一发现揭示了逆转录因子横向传播的新途径。
工程化抑制性tRNA（sup-tRNA）能够通过通读提前终止密码子来挽救由CFTR基因无义突变引起的囊性纤维化。这类经过修饰的天然tRNA面临活性不足、免疫原性和递送挑战等应用限制。该研究亮点发表于9月22日的《Nature Reviews Drug Discovery》。
空军军医大学窦科峰团队在NBE发表研究，利用基因编辑猪肝原位移植脑死亡人体，实现11天功能维持，为解决器官短缺的异种移植提供关键证据。原文指出肝脏免疫学和生理学复杂性使原位异种移植仍具挑战，此前仅有辅助代谢支持报道。
推荐理由：报道基因编辑猪肝原位移植脑死亡人体维持功能11天，为异种器官移植提供关键临床前证据。
Schargel 等人将 TnpB 家族蛋白改造为最小的从头设计 RNA 指导的转座系统。核酸酶缺陷型 TnpB 家族蛋白能以高效率、靶点免疫、方向控制和可编程插入细菌染色体的方式实现三组分 DNA 整合。同时，对野生型 V-K CAST 中 TniQ-TnsC 界面的突变减弱了脱靶转座。
研究团队通过诱变筛选开发出高效UAA抑制性tRNA，并优化AAV表达载体和RNA聚合酶III启动子。系统递送这些sup-tRNA在小鼠模型中恢复了全长dystrophin表达，改善了肌肉力量和运动功能，且剂量低于AAV微抗肌萎缩蛋白疗法。未观察到不良毒理学反应，并实现了全蛋白质组分子病理生理学的逆转。
推荐理由：研究通过系统递送抑制性tRNA在小鼠模型中恢复了全长抗肌萎缩蛋白并改善肌肉功能，为杜氏肌营养不良的无义突变治疗提供了新思路。
NEJM刊发研究探讨慢病毒体内CD19 CAR-T治疗神经系统自身免疫性疾病。该策略靶向B细胞，旨在解决传统体外CAR-T制备复杂、需淋巴清除化疗的局限；与瞬时mRNA CAR平台不同，慢病毒载体可通过单次给药实现稳定基因组整合。
研究团队结合天然蛋白结构域与AI设计的合成蛋白组装体，构建了100多种不同大小和形状的RNA递送载体，其RNA递送效率比常用载体高几个数量级。通过计算设计的肽结合物可编程载体趋向性，在多种细胞模型中递送治疗性RNA。在小鼠体内显示近单细胞分辨率的生物分布并确认安全性，在患者来源细胞和猪模型中成功应用于杜氏肌营养不良的基因编辑治疗策略。
推荐理由：通过AI设计合成蛋白组装体构建了100多种非病毒RNA递送载体，在小鼠和猪模型中验证了安全性和基因编辑治疗效果。
紫外线在酵母单链DNA中诱导产生一系列非典型突变，包括AT>AM、GT>GV、AC>AA、AT>TT和TA>TT等替换类型。缺乏Rad30的突变谱显示Pol η在CPD和6-4-PP旁路中起主要作用，而pol ε突变体（pol2 M644G）能特异性减少亚端粒区的经典和非经典UV突变。
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研究人员开发了名为 DIAL 的高度模块化可扩展框架，用于构建可编辑启动子以实现转基因表达的精细可调和可遗传改变。DIAL 通过重组酶介导的间隔序列切除来调节合成锌指转录因子与核心启动子之间的距离，从而产生可调的单峰表达设定点。该框架支持小分子控制的时序表达调控，并可通过慢病毒递送在原代细胞和诱导多能干细胞中实现多个稳定表达水平。
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研究开发了一种DNA中心策略，通过理性设计嵌合附着位点优化位点特异性重组。高活性att变体在HEK293T细胞中整合效率达51.9%（较野生型提高1.7倍），在水稻原生质体中达35.6%（提高4.4倍）。优化系统在人类细胞中实现CD19 CAR表达框31%和鸟氨酸氨甲酰转移酶表达框25%的靶向整合效率；在水稻中实现5.8 kb除草剂抗性框24%的稳定整合，长读长测序显示插入完整精确且可遗传。
推荐理由：通过理性设计嵌合附着位点，该方法在植物和人类细胞中均显著提高了位点特异性整合效率，为基于重组酶的基因编辑提供了通用策略。
CRISPR KNIT编辑通过Cas9切口酶与DNA供体招募系统耦合，实现了0.7–10 kb DNA片段的定点敲入且无需双链断裂。该系统效率最高达89%，显著降低了indels、易位和脱靶编辑，并支持多轮插入和多基因座敲入。
推荐理由：该方法通过避免双链断裂降低了脱靶和易位风险，为CAR-T等细胞疗法提供了非病毒工程化路径。
研究设计了优化的表观遗传调节剂 EpiReg，在食蟹猴中通过单次 LNP 递送实现 PCSK9 的高效（>90%）和持久（343 天）沉默，并降低 LDL-C 水平。多组学分析显示 EpiReg-T 在猴、鼠和人源细胞中脱靶效应极小。该平台可通过改造 DNA 结合域重定向至其他基因。
推荐理由：研究在非人灵长类中验证了单剂量即可实现长期基因沉默，为表观遗传编辑的临床转化提供了体内数据。
研究对533例接受ICiCLe-ALL-14方案治疗的儿科B-ALL患者进行WHO5重新分类，81.2%的患者鉴定出亚型定义基因组异常。PAX5alt和MEF2D-r亚型与较差的3年无事件生存率相关（分别为32.8%和33.7%）。
推荐理由：研究结合基因组亚型和MRD状态提出了三层次的风险分层模型，为儿科B-ALL的精准治疗提供了新的分层依据。
研究人员开发出启动子编辑框架DIAL，可将瞬时输入信号转化为原代细胞和人诱导多能干细胞中转基因表达的稳定设定点。该技术使治疗相关细胞中基因回路的可预测编程成为可能，其稳定性在细胞命运编程过程中得以保持。
研究利用碱基编辑或引物编辑在造血干/祖细胞中引入KIT胞外域突变，结合破坏BCL11A红系增强子以促进胎儿血红蛋白表达。该策略在抗KIT单抗选择性压力下实现KIT和BCL11A多重编辑造血细胞的体内共选择富集，避免了克隆选择，为镰状细胞病和β-地中海贫血等血红蛋白病提供了无需化疗或放疗的新型造血替代方案。
推荐理由：通过表位编辑实现非基因毒性移植和体内选择，为血红蛋白病等疾病提供避免化疗或放疗的替代方案。
对469个神经元单细胞全基因组测序发现，C9ORF72 ALS、C9ORF72 FTD和AD患者神经元中体细胞突变增加，22% ALS、76% FTD和61% AD神经元出现类似TOP1介导诱变的特征性sIndel过程。RADAR检测证实TOP1- DNA共价复合物增加，表明TOP1相关基因组不稳定性是TDP-43和tau蛋白病的共同机制。
推荐理由：研究通过单细胞全基因组测序发现三种神经退行性疾病共享的TOP1介导基因组损伤机制，为开发共同治疗策略提供新靶点。
研究开发了一种全RNA平台，利用CRISPRoff和CRISPRon表观编辑器在原代人T细胞中实现高效、持久和多路复用的表观遗传编程，稳定关闭或开启内源基因。该平台无需持续表达CRISPR系统，表观沉默在多次细胞分裂、T细胞刺激和体内过继转移中保持稳定。研究还结合了Cas12a-dCas9正交系统，实现靶向CAR敲入和表观沉默，改善了临床前CAR-T细胞的体内肿瘤控制和生存。
研究团队结合prime editing和体细胞核移植技术成功构建了表达校对缺陷型POLG的线粒体突变猪模型。这些猪表现出体细胞线粒体DNA突变负荷升高和早衰表型，包括体重减轻、毛发粗糙、贫血、皮肤和睾丸间质结构改变、细胞凋亡增加和衰老相关标志物上调，最终导致寿命缩短。该模型因猪与人类生理代谢相似性，成为研究线粒体DNA突变在衰老及相关病理中机制作用的理想临床前工具。
推荐理由：通过prime editing和体细胞核移植技术构建了线粒体突变猪模型，模拟了人类衰老相关表型，为研究线粒体DNA突变机制提供了新工具。
研究团队开发了自动化遗传 tRNA 扩展（AGENTEX）方法，用于在无细胞翻译系统中进行遗传密码的多重机器人原型构建。他们发现 tRNA 3' 末端对突变具有显著灵活性，大多数非 CCA-3' tRNA 可被大肠杆菌氨酰 tRNA 合成酶氨基酸化。
推荐理由：研究揭示了 tRNA 3' 末端突变对氨基酸化的广泛耐受性，为设计非天然遗传密码提供了可扩展的自动化方法。
研究对30例费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者进行纵向全基因组和靶向测序，整合克隆动态与7986次血常规和临床病史。不同的进化模式区分了稳定与进展性疾病，白血病转化通过TP53缺失、复杂克隆内逐步获得驱动突变或独立白血病克隆出现。
推荐理由：研究通过纵向全基因组测序揭示了骨髓增殖性肿瘤向白血病转化的不同基因组进化路径，为高风险患者的早期识别提供了依据。
CRISPR-KOALA 体内筛选系统识别出复发性臂水平拷贝数变异中具有推定致癌或抑癌功能的基因。获得性驱动基因表达改变有助于非整倍体的进化优势。该方法可应用于其他疾病背景的驱动因子鉴定，并突出了一系列基底样乳腺癌的潜在可靶向驱动因子。
研究者开发了名为 Prime Assembly (PA) 的可编程基因替换工具，利用 prime editing 在基因组和供体 DNA 上产生 3'-flap 实现精确退火。
CRISPR筛选鉴定Dusp5和Zfp219为衰老相关T细胞功能障碍的关键调控因子，敲除任一基因可驱动T细胞进入效应样状态，通过不同机制改善衰老肿瘤微环境中的肿瘤控制。
体内 CRISPR 基因编辑疗法 Lonvoguran Ziclumeran 在遗传性血管性水肿患者中显示出治疗潜力。该疗法旨在通过单次给药持久降低 KLKB1 基因表达，从而减少激肽释放酶生成和血管性水肿发作。这项发表于《新英格兰医学杂志》的研究报告了其初步安全性和有效性数据。