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bioRxiv / medRxiv 上尚未同行评审的新结果。

最新精选

第 41–60 条 · 共 67 条
9月25日周五
  1. bioRxiv Genomics51

    单核多组学资源揭示四种脑区中影响脑相关性状的关键神经细胞类型

    研究对来自11名捐献者4个脑区的约14万个细胞核进行了基因表达和染色质可及性分析,并与全基因组关联研究数据整合,以识别与复杂性状相关的特定神经细胞群。数据支持与阿尔茨海默病相关的推定增强子-基因关系,为解释性状相关遗传变异提供了资源。

9月24日周四
  1. medRxiv Oncology52

    基于DNA甲基化的肉瘤分类器v13.1在4377例样本中实现98%的类别准确率

    研究团队基于4377个肉瘤和间叶性肿瘤的甲基化谱开发了新版肉瘤分类器v13.1,涵盖116个肿瘤亚类和93个甲基化类别。在1547例独立验证队列中,73%的病例获得分类器预测,其中91%与原始组织病理学诊断匹配,并为6%组织学不确定病例提供了分子诊断重新分类。

    推荐理由:该分类器在四个独立队列中验证了91%的诊断匹配率,并为6%的组织学不确定病例提供了分子诊断。

9月23日周三
  1. medRxiv Oncology55

    癌症相关成纤维细胞中的2型脱碘酶:多种癌症的潜在治疗靶点

    研究发现2型脱碘酶(DIO2)在甲状腺癌等七种实体瘤的癌症相关成纤维细胞(CAF)中特异性表达,且与肌成纤维细胞样CAF亚型相关。高DIO2表达在胰腺癌和膀胱癌中与较差总生存期相关。TPO-CreERT2/BrafV600E/Trp53缺陷小鼠模型显示CAF特异性Dio2表达,遗传敲除Dio2可显著减少肿瘤生长。该研究提示DIO2可能成为靶向肿瘤微环境的新治疗策略。

    推荐理由:研究通过多癌种单细胞数据发现CAF中DIO2表达与不良预后相关,并在小鼠模型中验证其促瘤功能。

9月22日周二
  1. medRxiv Oncology54

    基因组基础模型 Evo2 提升软组织肉瘤的临床病理和转录组预后预测能力

    研究团队利用基因组基础模型 Evo2 对软组织肉瘤患者的肿瘤基因组变异序列进行嵌入,生成患者水平的基因组表征。在包含102名患者的队列中,将Evo2特征加入临床病理模型SARCULATOR后,总体生存(OS)的C-index从0.620提升至0.770,无进展生存(PFS)从0.625提升至0.755。

    推荐理由:研究将基因组基础模型与临床病理和转录组模型结合,在多个生存终点上展示了预后预测能力的提升。

9月21日周一
  1. medRxiv Oncology54

    Ataraxis Breast CTX多模态AI模型在HR+/HER2-早期乳腺癌中分层残余风险并识别治疗升级候选者

    Ataraxis Breast CTX多模态AI模型整合临床变量和H&E图像特征,在III期UNIRAD试验(NCT01805271)的556名患者队列中进行前瞻性-回顾性验证。

    推荐理由:该研究在已完成的III期试验队列中验证了AI模型对辅助治疗决策的潜在指导价值,为高风险患者分层提供了具体数据。

  2. medRxiv Oncology54

    黑色素瘤中富集蜕膜样NK细胞并通过肿瘤细胞接触获得CD9

    研究发现黑色素瘤中存在CD56 Bright CD16 − CD49a + CD9 + 蜕膜样NK细胞,该细胞在患者外周血中罕见。在肿瘤浸润淋巴细胞疗法探索性队列中,疾病进展患者肿瘤内该细胞频率更高。共培养实验表明,健康供体NK细胞通过与表达CD9的黑色素瘤细胞直接接触可诱导CD9的获得。

    推荐理由:研究揭示了黑色素瘤微环境中存在一种特殊的NK细胞亚群,并发现其标志性分子CD9的获得依赖于与肿瘤细胞的直接接触。

  3. medRxiv Oncology30

    尿液 DNA 甲基化作为泰国非肌层浸润性膀胱癌潜在诊断与监测工具的初步研究

    尿液游离 DNA 甲基化分析可有效区分泰国非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者与健康对照。该试点研究在 5 例高级别 NMIBC 患者和 3 名健康志愿者中,通过 cfMeDIP-seq 鉴定出 82 个差异甲基化区域(调整后 P<0.001),其中 MIR124-3、IRX4 和 LHX1-DT 呈现显著高甲基化。

9月20日周日
  1. medRxiv Oncology57

    基于甲基化的ctDNA用于非病毒相关头颈癌治疗后监测

    一项针对50名非转移性非病毒相关头颈鳞癌患者的回顾性队列研究显示,基于甲基化的Guardant360 ctDNA检测在监测复发时敏感性为76.9%,特异性为94.6%(AUC 0.858)。ctDNA阳性与更差的无进展生存和总生存相关,并在60%的复发患者中比临床发现提前中位131天检测到信号。

    推荐理由:研究评估了基于甲基化的ctDNA检测在非病毒相关头颈癌术后监测中的表现,并提供了敏感性、特异性及生存关联数据。

  2. medRxiv Oncology66

    AI模型Ataraxis CTX在TAILORx试验中识别HR+/HER2-乳腺癌中危患者的化疗获益

    基于TAILORx试验6735例患者数据的分析显示,AI模型Ataraxis CTX整合H&E切片形态特征和临床变量,其预后预测(CTX-prognostic)与无病间期显著相关(HR 1.651,95% CI 1.511-1.803)。在21基因复发评分中危亚组中,CTX-benefit模型识别出化疗高获益患者,其5年无病间期率增加5.6%,而低获益患者未见明显获益(交互作用p=0.016)。

    推荐理由:AI模型在21基因复发评分中危患者中识别出化疗获益亚组,为现有临床决策工具提供了补充信息。

9月17日周四
  1. medRxiv Oncology61

    基于大语言模型的 MSK-Tox 资源揭示肿瘤系统治疗毒性的临床与遗传决定因素

    研究者开发了一种基于大语言模型的方法,构建了包含超过5万名患者的泛癌种毒性资源 MSK-Tox。分析六种代表性不良事件发现,毒性模式受癌症类型、治疗方案和临床背景影响。研究识别了两种胚系易感性模式:器官固有模式(如 FOXE1 附近调控变异与甲状腺功能减退相关)和免疫介导模式(HLA-DRB1*15 是免疫检查点抑制剂治疗患者肾上腺功能不全的主要决定因素)。

    推荐理由:研究识别了两种胚系易感性模式,包括与免疫检查点抑制剂相关的 HLA-DRB1*15 等位基因,为治疗前毒性风险预测提供了新维度。

9月16日周三
  1. medRxiv Oncology56

    染色质调节因子突变谱揭示与免疫检查点治疗生存改善相关的癌种特异性及跨癌种复发基因集

    研究通过发现和验证队列分析了10种癌症类型,发现每种癌症都存在一组与免疫检查点抑制剂(ICI)治疗后生存改善相关的染色质调节因子(CR)基因突变。跨癌种存在一组复发性CRs与ICI疗效改善相关,且多个CR突变共现可进一步改善生存。CR突变组肿瘤突变负荷(TMB)更高,肿瘤微环境存在癌种特异性差异。

    推荐理由:研究识别了多个癌种中与免疫检查点抑制剂疗效改善相关的染色质调节因子突变组合,为生物标志物开发提供线索。

9月15日周二
  1. medRxiv Oncology49

    Beyond tumor volume: connectomic measures de tumor burden provide superior prognostic information across tumor compartments in glioblastoma

    一项针对999名新诊断胶质母细胞瘤患者的多中心研究表明,基于白质通路受累情况的病变-纤维束密度指数(L-TDI)比传统肿瘤体积能更稳健地预测总生存期。L-TDI在不同阈值和肿瘤区域均显示出与生存期的强关联,其预后价值在调整已知临床变量后依然存在,而肿瘤体积的预后价值则高度依赖于分析设计且主要局限于对比增强区域。这些发现凸显了将胶质母细胞瘤视为全脑疾病进行预后评估的重要性。

  2. medRxiv Oncology52

    前瞻性宏基因组研究揭示肛门鳞癌与高级别鳞状上皮内病变的独特厌氧微生物特征

    研究发现肛门鳞癌(ASCC)患者相比高级别鳞状上皮内病变(HSIL)患者具有较低的微生物丰富度和独特的厌氧菌群特征。在121名参与者中,ASCC组鉴定出6种富集的厌氧菌,包括具核梭杆菌和微小单胞菌等,这些菌种与氨基酸代谢和厌氧代谢通路相关,且在纵向采样中持续存在。

    推荐理由:通过前瞻性宏基因组分析识别出6种与肛门鳞癌相关的厌氧菌,为理解微生物在癌变进程中的作用提供了新线索。