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#生物标志物

今日 3 条
今天10月2日周五
  1. 监管与产业情报(Pharma-Intel)26

    科学聚焦:突变检测无法捕获的 CDK4/6 抑制剂耐药机制

    近期多项研究提示,ER+/HER2– 乳腺癌对 CDK4/6 抑制剂的耐药涉及肿瘤细胞的基因调控与代谢重编程,而非仅靠新增突变可解释。进展后 ESR1 等可成药改变可指导下一线治疗选择,这类突变使 ER 在雌激素剥夺下仍保持活性,为 ER 降解剂等药物提供理论依据。

  2. bioRxiv Genomics45

    遗传风险与炎症信号汇聚于1型糖尿病的细胞类型特异性调控程序

    研究者整合人胰岛表观基因组、GWAS及PANC-DB数据,应用ChromBPNet与转录因子足迹分析,鉴定出多个1型糖尿病相关SNP可改变β细胞等细胞类型特异性增强子处的染色质可及性与转录因子结合。这些发现将遗传风险与细胞内在调控程序关联,为机制研究提供候选靶点。

10月1日周四
  1. 文献与产业新闻(bio-brief)30

    汉族荨麻疹来源 PRS 与慢性自发性荨麻疹易感性及高级系统治疗使用的关联

    台中荣民总医院利用台湾精准医学计划数据,对 4,676 例 CSU 患者与 18,704 名匹配对照分析发现,Lassosum 模型汉族荨麻疹来源 PRS 预测能力最高,PRS 最高分位与 CSU 易感性升高显著相关。在 4,550 例有 PRS 数据的 CSU 患者中,高 PRS 分位与高级系统治疗使用相关,并存在性别分层差异,提示该 PRS 可作为 CSU 遗传风险分层辅助标志物。

  2. 顶刊论文(社媒热度)46

    真实世界混合癌种队列揭示癌症及治疗不良事件相关微生物组特征

    Mayo Clinic Cancer Microbiome 队列纳入1,364例癌症患者与287名健康对照,在五类癌症中识别出341种癌症相关菌种;早发性乳腺癌患者粪便胆汁酸及C. scindens水平降低,早发性结直肠癌患者乳酸及Veillonella parvula升高;携带二氢嘧啶脱氢酶编码基因的Anaerostipes hadrus对5-氟尿嘧啶所致腹泻具有保护作用。

  3. bioRxiv Cancer Biology50

    BRCA1相关三阴性乳腺癌的细胞起源塑造肿瘤亚型

    研究揭示BRCA1相关的三阴性乳腺癌(TNBC)可起源于基底-肌上皮细胞,且细胞起源通过异常上皮分化塑造了TNBC亚型。对Wap-Cre Brca1/p53小鼠67,001个细胞的单细胞RNA测序分析表明,异常的基底-肌上皮分化产生间充质亚型(TNBC-M),而异常的管腔分化产生基底样亚型(TNBC-BL1)。

  4. Nature44

    人群规模免疫多组学图谱揭示疾病调控机制

    FinnGen研究发布了人群规模的免疫细胞单核多组学图谱,揭示了调控疾病风险的染色质可及性数量性状位点和表达数量性状位点。该图谱整合了来自芬兰生物样本库的个体水平数据,并公开了汇总统计数据供交互式浏览。研究人员可通过特定渠道申请访问个体水平数据以进行深入分析。

  5. Nature24

    OpenAI 基金会启动 250 亿美元科学资助计划,首轮 1.25 亿美元投向健康与生命科学数据项目

    OpenAI 基金会已承诺投入至少 250 亿美元用于科学资助,并于本月拨付了 1.25 亿美元的首轮资金,用于支持创建开放的健康与生命科学研究数据。此轮资助包括向美国北卡罗来纳大学教堂山分校的癌症疫苗项目提供 4000 万美元,以及向旨在改进药物穿越血脑屏障预测能力的项目提供 1500 万美元。该基金会计划重点关注阿尔茨海默病、公共卫生数据和高负担疾病三大生命科学领域。

  6. Nature20

    暴露组学能否成为实现个性化医疗的关键?

    暴露组学旨在通过整合环境暴露、生活方式与基因组数据,实现对个体疾病风险的精准评估与预防。一项基于美国国家健康与营养调查数据的研究发现,结合20种暴露因素可解释参与者甘油三酯水平43%的变异,其预测能力与遗传变异相当。该领域的发展有望推动精准医学进入以预防为主的新时代。

9月30日周三
  1. medRxiv Oncology42

    绘制肿瘤异质性图谱:利用 3D 功能精准平台检测匹配原发灶与转移灶的体外药物响应

    SageMedic 团队用 3D 微肿瘤平台对比 7 例匹配原发与转移灶的 275 个药物响应,局部转移灶响应与原发灶高度一致(ρc=0.91-0.97),淋巴道及血行转移灶相关性显著降低(ρc=0.58-0.87)。拆分样本验证极高复现性(ρc=0.95),单部位功能分析仍可识别耐药、降低无效治疗风险。

  2. 监管与产业情报(Pharma-Intel)29

    汉族荨麻疹来源PRS与慢性自发性荨麻疹(CSU)易感性及高级系统性治疗使用的关联

    汉族荨麻疹来源PRS四分位越高,慢性自发性荨麻疹(CSU)易感性越高(尤其Q4),高分位也与高级系统性治疗使用相关(4,550例),存在性别分层差异。该回顾性研究纳入4,676例CSU患者与18,704例匹配对照,评估五种PRS模型,基于Lassosum的PRS曲线下面积最高。

9月29日周二
  1. STAT News14

    MAHA Institute 倡导扩大美国健康数据共享

    MAHA Institute 在周一的活动上强调了向联邦研究人员开放患者健康记录对慢性病起源研究的益处。该机构希望整合来自各州的免疫记录、临床数据和药房信息,为研究人员提供更完整的数据集。然而,使用此类数据进行研究可能面临患者隐私、伦理和法律问题,内布拉斯加州与联邦政府的合作模式被视为州-联邦混合数据治理的范例。

  2. bioRxiv Genomics32

    PfPHAST:一种用于疟疾基因组监测的简化靶向测序工具

    研究人员开发了用于恶性疟原虫公共卫生监测的靶向测序工具PfPHAST,该工具包含56个靶点,涵盖耐药性、诊断缺失和疫苗靶点基因分型等关键位点。在实验室菌株对照测试中,PfPHAST在匹配测序深度下比其前身MAD4HatTeR面板具有更高的质量控制通过率(94.4% vs 90.0%),且在共享靶点上性能相当。PfPHAST通过聚焦程序化相关靶点,为常规疟疾分子监测提供了一个可扩展的低成本替代方案。

  3. Nature8

    语言保护对生物多样性保护至关重要

    一种土著语言的消失可能意味着其中蕴含的生态和药用知识的丧失。尽管语言使用的衰退可以逆转,但相关的复兴努力在国家立法和政策中仍被忽视。政府应为社区主导的语言沉浸式教学、家庭与土地学习以及有助于语言传承的数字工具提供持续支持。

9月28日周一
  1. medRxiv Oncology54

    血清甲状腺激素代谢物检测用于甲状腺结节分子诊断评估

    一项针对 1663 名甲状腺结节患者的队列研究开发了一种基于血清甲状腺激素代谢物(THMs)的分子血液检测方法。在模型验证中,该检测区分分化型甲状腺癌(DTC)与良性结节的特异性为 99.5%,敏感性为 92.3%,诊断准确率为 95.9%。

    推荐理由:该研究在不确定的 Bethesda III-IV 类结节中实现了 100% 的阳性预测值和 93.5% 的敏感性,可能减少不必要的诊断性手术。

  2. bioRxiv Cancer Biology32

    多数据库生物信息学分析揭示 MET 基因表达在胃癌中的预后价值、信号互作网络及免疫浸润特征

    MET 基因在胃癌组织中的表达显著高于正常胃黏膜,且其高表达与较差的总体生存期和无进展生存期相关。蛋白互作网络分析显示 MET 与 EGFR、ERBB2、HGF 等 20 个关键蛋白存在相互作用,其相关基因在 ERBB 信号通路、同源重组等通路中显著富集。多种算法交叉验证表明 MET 表达与胃癌的免疫细胞浸润水平相关。

  3. bioRxiv Cancer Biology53

    突变顺序与选择如何共同塑造肿瘤进化中的瘤内异质性

    研究者开发了一个多类型分支过程模型,分析两种驱动突变不同获得顺序如何影响肿瘤克隆结构。模型显示驱动基因对异质性的影响取决于其获得时机:早期获得的强驱动基因增加中间谱系和恶性创始克隆供应,而晚期获得的同一驱动基因则强化早期 founded 克隆的生长优势。在加性适应度效应下,选择优势与克隆浓度可呈现非单调关系。

  4. bioRxiv Cancer Biology58

    空间转录组学揭示导管原位癌微环境与侵袭性乳腺癌复发的关联

    研究对49例原发性导管原位癌标本进行空间转录组学分析,发现肿瘤近端区域TREM2+巨噬细胞和肌成纤维样癌相关成纤维细胞富集,且TREM2+巨噬细胞丰度与后续侵袭性乳腺癌复发相关。配体-受体对分析识别出GRN-SORT1、SPP1-CD44和LGALS9-CD44等潜在的空间信号交互,并通过多重免疫染色在蛋白水平验证了这些发现。

    推荐理由:研究通过空间转录组学揭示了导管原位癌中TREM2+巨噬细胞与侵袭性复发风险的关联,为开发预后标志物提供了线索。

9月27日周日
  1. medRxiv Oncology46

    FRANK:一种采用数据高效学习的泛癌种儿童肿瘤 RNA-seq 分类器

    FRANK 机器学习模型利用 11,467 个转录组数据对 181 种儿童肿瘤及正常组织类型进行分类,在包含 16,398 个样本的九个数据集中实现 98.3% 的总体准确率。该模型在长读长 RNA 测序数据以及噪声和低质量数据中保持准确性,并在外部数据集上优于其他已发表的儿童泛癌种 RNA-seq 分类器。

9月26日周六
  1. 监管与产业情报(Pharma-Intel)54

    人抗生素干预研究显示血浆吲哚-3-丙酸源自肠道菌群并与2型糖尿病及心脏代谢结局相关

    一项7天广谱抗生素人体干预研究显示,血浆吲哚-3-丙酸(IPA)几乎完全由肠道菌群产生。抗生素使用前IPA在2型糖尿病患者中水平更低且与较低T2D几率相关,并呈此前未见报道的与血糖变异度负相关;IPA相关菌种聚类在同一共丰度模块中但未包含已知产IPA菌种,提示血浆IPA受更广泛菌群结构影响。DOI: 10.1080/19490976.2026.2736321

9月25日周五
  1. BioSpace23

    SPEEDCELL 项目完成首年建设,推动生物制造应对疫情准备与商业化挑战

    SPEEDCELL 项目完成首年活动,建立了加速生物药开发的技术与运营基础。该项目由西班牙生物制药公司 HIPRA 协调、欧盟共同资助,旨在构建一个可应用于常规疫苗和生物药项目的模块化开发与制造平台。行业共识是,可持续的疫情防备需要在紧急情况之间通过商业生产维持制造能力的运营和经济可行性。

  2. The Lancet Oncology35

    全球基本抗癌药物应用与复杂基因组诊断需求相关性的回顾性观察研究

    一项研究显示,在基本药物清单(EML)中,需要复杂基因组诊断的精准抗癌药物应用率较低,且在低收入国家的应用最为有限。该回顾性观察研究分析了不同GDP水平国家的药物应用差异。结果表明,仅将药物纳入EML可能不足以确保患者可及性,尤其在精准肿瘤学药物日益增多的背景下。

  3. Nature Medicine21

    多基因评分在英国国民医疗服务体系中的应用:争论焦点并非证据本身

    PHG Foundation于2026年2月召集圆桌会议,探讨在英国国民医疗服务体系(NHS)中负责任地应用多基因评分的考量。争论的核心在于对多基因评分预期作用的基本模糊性,以及围绕终点、对照标准和性能阈值的证据权重与解读差异。英国政府计划到2035年建立新的基因组人口健康服务,并将多基因评分列为一项组成部分。

  4. Nature Cancer0

    解析人类癌症中复杂的突变现象词汇

    研究界已识别出多种复杂的癌症基因组突变模式,包括染色体碎裂、染色质环化、kataegis以及APOBEC酶介导的突变簇。这些模式由不同的分子机制驱动,例如DNA修复错误、染色体分离异常以及APOBEC3A等酶在治疗压力下的活性。理解这些突变特征对于阐明癌症的演化机制和耐药性的产生至关重要。

9月24日周四
  1. Nature36

    AlphaFold 数据库新增常见病毒蛋白复合物结构

    AlphaFold 蛋白质结构数据库于 9 月 24 日新增了 8,000 多个病毒蛋白二聚体的预测结构,涵盖 23 个能感染人类的病毒家族。此次更新是 AlphaFold 数据库内“大流行防范门户”启动的一部分,旨在弥补病毒蛋白结构数据的空白。研究人员分析了近 2,800 种病毒的蛋白质序列,但仅有约 8,000 个预测结果因准确性达标被纳入数据库。

    推荐理由:热度:X 浏览 7.4 万

9月23日周三
  1. NEJM32

    常见疾病相关常见遗传变异的临床应用

    文章综述了常见遗传变异在常见疾病临床管理中的应用现状与前景。内容涵盖利用多基因风险评分进行疾病风险分层、指导筛查策略以及优化药物治疗选择。该综述旨在为临床医生整合遗传信息以改善患者预后提供实用框架。

    推荐理由:热度:X 浏览 3.5 万

  2. medRxiv Oncology50

    BRCA1/2 携带者的乳腺 X 光检查利用率和男性乳腺癌

    一项针对 810 名 BRCA+ 男性的回顾性队列研究显示,仅有 19% 的人有乳腺 X 光检查记录,在符合年龄条件且无既往病史的 562 名男性中,实际完成筛查的比例仅为 16%。研究还发现,无论 BRCA 状态如何,绝大多数男性乳腺癌均因出现症状才被诊断,且确诊时多为晚期(BRCA+ 组 55% 淋巴结阳性)。这表明高危男性的乳腺癌筛查实践亟待改进。

9月22日周二