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今日 64 条
9月25日周五
  1. Cell54

    细胞内发现并表征非经典细菌蛋白转运-折叠复合物

    研究人员利用细胞内冷冻电镜断层扫描结合蛋白质组学、整合结构建模和生物信息学,在最小细菌肺炎支原体中发现了一个连接 Sec 依赖蛋白转运与胞外折叠的复合物。该复合物能够同时支持共翻译和翻译后途径。

    推荐理由:该方法整合了冷冻电镜断层扫描与蛋白质组学,可在细胞内直接发现未表征蛋白复合物,为细菌蛋白转运机制研究提供了新工具。

  2. Nature Biotechnology61

    光不稳定寡核苷酸结合拓扑光梯度实现空间分辨的单细胞转录组与表观基因组分析

    研究团队开发了 scSTAMP-seq 方法,利用光不稳定寡核苷酸和数字微镜器件产生的拓扑光梯度,在单细胞水平上实现 mRNA、DNA 可及性和 DNA 甲基化的空间解析。该方法在人类 iPSC 来源的胃泌样体中验证了 CDX2、SOX17 等谱系标记基因的空间表达模式,并分析了染色质调节因子的分布。数据已存入 GEO(GSE237524),代码开源在 GitHub。

    推荐理由:该方法通过光控寡核苷酸和拓扑光梯度实现了单细胞水平上转录组和表观基因组的同时空间解析,为研究组织发育和疾病机制提供了新工具。

9月24日周四
  1. 中文产业新闻(药渡 / pharmcube)65

    沈柏用/Florent Ginhoux团队揭示组织驻留巨噬细胞通过构建硒保护生态位维持胰腺癌侵袭性

    研究发现富集于肿瘤边界的组织驻留巨噬细胞能够向高侵袭性的胰腺导管腺癌细胞提供硒蛋白Selenop,协助其逃避铁死亡并维持侵袭状态。这一发现揭示了免疫细胞作为营养和代谢物质供体,直接维持恶性肿瘤细胞特定侵袭状态的新肿瘤微环境代谢支持模式。

    推荐理由:该研究揭示了巨噬细胞通过提供硒蛋白支持肿瘤细胞抵抗铁死亡的新机制,为理解肿瘤微环境的代谢支持功能提供了新视角。

  2. 中文产业新闻(药渡 / pharmcube)60

    浙江大学王福俤团队在《Nature》发表铁死亡调控新靶点MFF的研究

    浙江大学团队在《Nature》发表文章,解析线粒体-过氧化物酶体协同调控铁死亡的机制。研究借助磷酸蛋白组初筛锚定MFF,并进行了从组学到体内药效验证,为肿瘤铁死亡研究提供靶点筛选范式。

    推荐理由:文章提供了一个从磷酸蛋白组初筛到体内药效验证的靶点筛选范式,可供一线肿瘤铁死亡研究参考。

  3. 中文产业新闻(药渡 / pharmcube)62

    单细胞多组学揭示大脑不同细胞类型与脑区的衰老轨迹不同步

    一项发表于 Cell 的研究通过单细胞多组学分析发现大脑衰老并不同步。研究构建了包含超过13万个单细胞的DNA甲基化图谱和超过7万个细胞的三维染色质构象图谱,显示少突胶质细胞前体细胞和少突胶质细胞中的年龄相关差异甲基化区域明显多于神经元。

  4. Science0

    二维可扭转材料数据库

    Science 期刊发布了一个二维可扭转材料数据库。该数据库收录了理论预测的可通过层间扭转调控其电子特性的二维材料体系。这一资源旨在为探索莫尔超晶格物理和设计新型量子材料提供系统的理论支持。

  5. bioRxiv Genomics45

    CMAC:一种用于绝对心肌细胞转录年龄估计的深度学习框架

    研究人员开发了深度学习框架 CMAC,用于估计心肌细胞的绝对转录成熟年龄。该模型整合了18个小鼠单细胞RNA测序数据集,在独立验证队列中对98,163个心肌细胞的预测误差仅为0.33天,并成功量化了PGC1{beta}双敲除模型中4.77至8.60天的成熟延迟。CMAC为量化心肌细胞发育偏离正常轨迹提供了统一工具。

  6. bioRxiv Genomics32

    优化网纹革蜱 Oxford Nanopore 序列的基因组组装、染色体同线性和遗传变异发现

    研究通过深度 Oxford Nanopore 测序,为三只网纹革蜱个体建立了高质量单倍型基因组组装,发现使用约两个 flow cell 的 Dorado 纠错原始读长数据并将组装覆盖度限制在 40 倍时可获得最优组装质量。优化的流程显著改善了支架的染色体同线性分析和转座元件的注释,并揭示两个不同地理种群网纹革蜱的遗传多样性相似。

  7. Cell65

    APOE4 通过周细胞向肌成纤维细胞转化导致脑血管退化

    APOE4 引起周细胞向肌成纤维细胞转化,促进脑血管纤维化和血管周围淀粉样蛋白积聚。TGF-β 抑制可逆转这种病理重塑,为高风险个体恢复脑血管稳态提供了治疗策略。

    推荐理由:研究揭示了 APOE4 风险等位基因通过周细胞向肌成纤维细胞转化导致脑血管纤维化的新机制,并提示 TGF-β 抑制可能逆转这一病理过程。

  8. bioRxiv Genomics42

    Convergent evolutionary loss of chemosensory and blood-feeding pathways in non-blood-feeding mosquitoes

    对包括三种非吸血蚊子在内的七个物种进行基因组和全脑图谱比较分析,揭示了与吸血行为丢失相关的趋同基因缺失。这些缺失涉及唾液血小板聚集抑制剂Aegyptin、血液激活丝氨酸蛋白酶以及两个与血液成分味觉检测相关的离子型受体分支。非吸血雌蚊的触角叶体积更小,表明其嗅觉输入减少,这些发现为解析复杂吸血性状的遗传基础提供了进化切入点。

9月23日周三
  1. NEJM10

    先天性羊膜带序列征

    先天性羊膜带序列征是一种由羊膜带缠绕胎儿肢体或躯干导致的出生缺陷。该病症可引发肢体缩窄环、截肢及严重畸形,其诊断主要依靠产前超声检查。治疗需根据畸形严重程度,采取多学科评估及个体化手术干预。