bioRxiv Genomics· Dillon, K. C., Sprong, H., Ronai, I., Choudhary, S., Grant, C., de Paula Baptista, R., Ray, D. A., Glenn, T. C. ·· 8 天前评分32
优化网纹革蜱 Oxford Nanopore 序列的基因组组装、染色体同线性和遗传变异发现
Optimizing genome assembly, chromosome synteny, and genetic variant discovery from Oxford Nanopore sequences of Dermacentor reticulatus ticks
导读
研究通过深度 Oxford Nanopore 测序，为三只网纹革蜱个体建立了高质量单倍型基因组组装，发现使用约两个 flow cell 的 Dorado 纠错原始读长数据并将组装覆盖度限制在 40 倍时可获得最优组装质量。优化的流程显著改善了支架的染色体同线性分析和转座元件的注释，并揭示两个不同地理种群网纹革蜱的遗传多样性相似。
来源：bioRxiv Genomics · biorxiv.org