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今日 31 条
10月1日周四
  1. 顶刊论文(社媒热度 · Vault)62

    早期 RNA 降解因子 ZC3H18 引导首内含子剪接的机制

    本研究显示 ZC3H18 与 PRPF40A、PRP4K、FNBP4 三个剪接因子互作,在全基因组范围内促进首内含子剪接。该功能依赖 CBC-ARS2-ZC3H18 轴;ZC3H18 与剪接因子的结合与其结合 NEXT 复合体(介导早期 RNA 降解)互斥,作者据此提出剪接因子将 ZC3H18 从 RNA 降解切换到剪接通路的模型。DOI: 10.1016/j.molcel.2026.09.009

    推荐理由:原文把首内含子剪接的 CBC 机制落到 ZC3H18 与剪接因子的互作上,并解释同一蛋白如何在剪接与 RNA 降解间切换。

  2. 顶刊论文(社媒热度 · Vault)63

    Dorsal 转录因子团簇在活体果蝇胚胎中增强基因表达但不改变转录爆发动力学

    在活体果蝇胚胎中,Dorsal 转录因子团簇结合部分内源靶基因并放大转录,但既不启动也不维持转录爆发,仅在爆发中增强聚合酶装载。研究使用前沿显微技术直接测量并操控活体转录,结合位点丰度决定团簇-基因结合,特异性破坏该结合的增强子突变导致致死发育缺陷。该结果挑战了关于转录因子团簇、hub 或凝聚体如何调控转录的主流模型。

    推荐理由:原文用活体胚胎成像直接检验转录因子团簇与转录爆发的关系,排除了团簇启动或维持爆发的模型。

  3. 顶刊论文(社媒热度 · Vault)64

    胰腺癌恶病质促进微环境的空间演化

    研究用单细胞与 Xenium 空间转录组在胰腺癌样本中定义出由 SEMA4A+ 肿瘤细胞、AQP9+ 巨噬细胞和 LOXL2+ 癌相关成纤维细胞组成的恶病质相关微环境生态位。

    推荐理由:原文用单细胞与 Xenium 空间转录组把胰腺癌恶病质生态位拆为 SEMA4A+/AQP9+/LOXL2+ 三类细胞并画出互作回路,对恶病质分型与靶点筛选有参照价值。

  4. 顶刊论文(社媒热度 · Vault)71

    肠道菌群经肠道树突状细胞 AHR 通路加重缺血性卒中

    Cell 发表的研究发现,产吲哚大肠杆菌富集与小鼠和缺血性卒中患者较差的预后相关,机制上依赖肠道树突状细胞中的 AHR。树突状细胞特异性敲除 AHR 可改善小鼠卒中结局并保留肠道 cDC1;药理抑制 AHR 能促进 DC 向脑膜迁移、增加调节性 T 细胞并减轻神经炎症,而去除调节性 T 细胞会消除该神经保护作用。

    推荐理由:原文同时给出基因敲除与药理抑制两套证据,把产吲哚大肠杆菌经 AHR 影响肠道 DC 这条通路定位为卒中预后的可成药节点。

  5. bioRxiv Genomics27

    智力与大五人格特质共享遗传与生物学基础

    约 90% 影响大五人格特质的遗传变异同时作用于智力,LD 分数回归、基因优先级排序与基因集富集分析均在 SNP、基因和生物学通路层面观察到二者显著重叠。多层级分析表明,智力与大五人格特质的遗传与生物学相似程度不亚于各特质彼此之间。

  6. bioRxiv Genomics28

    创造力背后因素呈现独特遗传结构并与精神疾病存在遗传相关性

    对六项创造力相关 GWAS 开展基因组结构方程建模,识别出一般因子与艺术因子两个潜在遗传因子,各对应 22 个和 13 个全基因组显著位点(9 个为新位点)。一般因子与受教育程度遗传相关近完全(rg = 0.96),主要反映认知与教育过程;艺术因子相关性弱(rg = 0.11),却与多种精神疾病呈遗传正相关,且具有独特的生物学富集模式。

  7. bioRxiv Genomics38

    乌干达及邻国恶性疟原虫种群结构与耐药性的全基因组特征分析

    研究对2023年乌干达26个哨点的249份单克隆恶性疟原虫基因组进行测序,并与5个邻国公开数据比较。PfPX1的PIN单倍型(L1222P、M1701I、D1705N)全国流行率达70%,合并D384A者集中于北部和东部,D384Y单倍型跨坦桑尼亚边境传播。乌干达全境遗传多样性高、分化低,为区域疟原虫耐药基因组监测提供了2023年基线。

  8. bioRxiv Genomics44

    系统发育动力学分析揭示登革病毒全球传播的不对称性与加速趋势

    研究者基于1940年代以来的全球DENV基因组数据,通过系统发育动力学方法重建传播路径,发现当前城市登革病毒的多样性源于20世纪上半叶的亚洲。全球传播呈不对称格局,亚洲洲内传播密度最高并持续向非洲与美洲输出;DENV主要经南亚进入北美,自2010年起向美洲的传播速率明显加快。研究指出旅行量而非气候因素是塑造DENV长期传播格局的主导变量,提示其扩散将继续加速。

  9. medRxiv Oncology51

    HPV阳性与阴性口咽鳞癌淋巴结转移模式的多中心欧洲分析

    一项对780例未经治疗口咽鳞癌患者的多中心回顾性分析显示,HPV阳性患者更常出现同侧II级淋巴结受累,尤其在早期T分期肿瘤中(80.6% vs 54.8%)。然而,HPV阳性患者发生隐匿性转移的比例低于HPV阴性患者(24.7% vs 48.7%)。数据表明,更高的淋巴结受累率未必转化为更高的隐匿性转移风险,不支持对HPV阳性肿瘤采用比HPV阴性肿瘤更大的选择性淋巴结照射靶区。

  10. bioRxiv Cancer Biology58

    肿瘤抑制基因样突变标记白血病中剂量约束的依赖性

    在急性早幼粒细胞白血病中,转录因子EBF3基因存在复发性杂合功能缺失突变,看似是肿瘤抑制基因,但对白血病生存却至关重要。研究发现,PML::RARA融合癌蛋白通过p300依赖性内含子增强子激活EBF3表达,但EBF3过量又会抑制增殖;患者突变通过杂合失活将EBF3活性优化在两端适应性约束的区间内。p300抑制可通过将EBF3压制至存活阈值以下来利用此约束。

    推荐理由:研究通过急性早幼粒细胞白血病模型,解释了为何一个看似肿瘤抑制基因的突变反而标记了癌细胞依赖的基因,并指出p300抑制可能利用这种剂量约束。

  11. bioRxiv Cancer Biology50

    BRCA1相关三阴性乳腺癌的细胞起源塑造肿瘤亚型

    研究揭示BRCA1相关的三阴性乳腺癌(TNBC)可起源于基底-肌上皮细胞,且细胞起源通过异常上皮分化塑造了TNBC亚型。对Wap-Cre Brca1/p53小鼠67,001个细胞的单细胞RNA测序分析表明,异常的基底-肌上皮分化产生间充质亚型(TNBC-M),而异常的管腔分化产生基底样亚型(TNBC-BL1)。

  12. bioRxiv Genomics37

    Evo 2 作为分类机器的证据:来自情境学习与机制可解释性的研究

    Evo 2 在涵盖生物与人工序列的五项二元分类任务中展现出稳健的情境学习能力,其在较短自然序列上表现优异(miRNA F1=0.902,Toxins F1=0.785),但性能随序列长度增加而下降并在千碱基尺度上崩溃。研究还发现模型缩放并无益处,7B 参数模型系统性地优于 40B 变体。机制可解释性分析揭示了预测与泛化之间的权衡,并表明模型可能追踪提示的结构而非信号承载内容。

  13. bioRxiv Cancer Biology38

    靶向 REV7 揭示结直肠癌细胞的有丝分裂脆弱性

    靶向 REV7 的小分子抑制剂 C10 使结直肠癌细胞 HCT116 和 HT29 对微管破坏剂秋水仙碱敏感,显著降低了克隆形成存活率。REV7 的基因缺失同样增加了对秋水仙碱的敏感性,证实了 REV7 依赖性微管破坏脆弱性。该研究拓展了靶向 REV7 在超越其经典 TLS 作用之外的潜在后果,表明 REV7 定向抑制与有丝分裂扰动相结合值得作为结直肠癌的潜在治疗策略进一步研究。

  14. Nature68

    交感神经激活与内源性逆转录病毒表达共同触发自身免疫性脱发

    研究发现调节性T细胞缺失后,交感神经激活通过β2-肾上腺素受体诱导毛囊干细胞表达内源性逆转录病毒,进而激活cDC1细胞和CD8+T细胞攻击毛囊。在小鼠模型中,阻断交感神经信号或逆转录病毒活性可防止脱发,揭示了神经免疫相互作用在自身免疫性疾病中的新机制。

    推荐理由:该研究通过小鼠模型揭示了交感神经激活与内源性逆转录病毒表达共同触发自身免疫性脱发的双打击机制。

  15. Nature61

    TBK1/ULK1信号轴将溶酶体应激与TFEB激活相偶联

    通过溶酶体的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析,研究发现了一条不依赖营养的mTORC1信号调控通路,介导溶酶体对压力的适应,其失调是滤泡淋巴瘤发生的基础。

    推荐理由:研究揭示了溶酶体应激通过TBK1/ULK1信号轴激活TFEB的机制,为理解滤泡淋巴瘤发生提供了新的分子基础。

  16. Nature54

    新生小鼠前脑的时空克隆结构

    研究利用克隆条形码技术分析了新生小鼠前脑的细胞谱系,发现谷氨酸能神经元和星形胶质细胞主要来源于局部,而广泛分布的GABA能谱系则将神经元与少突胶质前体细胞联系起来。

    推荐理由:该研究通过克隆条形码技术揭示了小鼠前脑发育过程中不同神经细胞谱系的空间分布规律,为理解大脑发育的细胞来源提供了新视角。

  17. Nature61

    GTAC:通过重编程GPCR内吞和降解实现受体拮抗的双功能抗体

    研究团队开发了GTAC双功能抗体,利用转铁蛋白受体1的组成性内吞作用诱导GPCR降解。在AT1R、RXFP1、CCR6和BILF1等多个GPCR模型中,GTAC实现了皮摩尔到纳摩尔级的受体降解效力,信号抑制效果比传统拮抗剂强10-100倍。该平台还展示了在iPSC心肌细胞、原代T细胞和银屑病小鼠模型中的功能活性。

    推荐理由:热度:X 浏览 1.9 万 · 2 个信源报道同一事件

  18. Nature60

    人源 tau 蛋白株在小鼠脑中呈现朊病毒样传播

    小鼠实验表明,阿尔茨海默病和皮质基底节变性来源的 tau 纤维在模板化播种过程中能保持其独特的结构。这一发现支持了 tau 蛋白株特异性传播和疾病建模的机制。

    推荐理由:实验展示了不同 tau 蛋白病来源的纤维在体内传播时能保持其独特的结构特征,为疾病建模提供了分子基础。

  19. Nature63

    人类遗传学研究揭示BACH2-NRF2轴在胎儿血红蛋白激活中的作用

    通过对28,279名多人群个体进行GWAS分析,研究发现BACH2通过限制NRF2介导的γ-珠蛋白基因转录激活来抑制胎儿血红蛋白表达。功能实验证实BACH2缺失可增强NRF2在γ-珠蛋白启动子和LCR区域的染色质占据,诱导HbF表达。该机制独立于已知的BCL11A通路,为血红蛋白疾病治疗提供了新靶点。

    推荐理由:研究通过多人群GWAS和功能实验揭示了BACH2-NRF2轴调控胎儿血红蛋白的新机制,为镰状细胞病和β地中海贫血提供了潜在治疗靶点。

  20. Nature44

    人群规模免疫多组学图谱揭示疾病调控机制

    FinnGen研究发布了人群规模的免疫细胞单核多组学图谱,揭示了调控疾病风险的染色质可及性数量性状位点和表达数量性状位点。该图谱整合了来自芬兰生物样本库的个体水平数据,并公开了汇总统计数据供交互式浏览。研究人员可通过特定渠道申请访问个体水平数据以进行深入分析。

  21. Nature39

    噻蒽鎓叶立德作为卡宾前体用于环丙烷化反应

    研究证实烷基噻蒽鎓盐可作为金属催化卡宾反应的高效卡宾供体,实现了未活化1,2-二取代和三取代烯烃的环丙烷化。该方法克服了传统硫鎓盐因硫化物路易斯碱性而难以进行卡宾转移的局限性,并能应用于σ-键插入和σ-迁移重排等反应。该平台为获取现有方法难以合成的复杂环丙烷结构提供了新途径。

  22. Nature74

    组蛋白阅读器MLLT1和MLLT3通过相分离机制富集AID赋予位点特异性

    研究发现组蛋白阅读器MLLT1和MLLT3通过相分离机制在基因组特定位点富集激活诱导胞苷脱氨酶(AID),从而调控抗体基因的体细胞超突变和类别转换重组。实验表明MLLT1/3缺失会损害AID的基因组定位和功能,而相分离能力是这一过程的关键机制。

    推荐理由:研究揭示了组蛋白阅读器通过相分离机制调控AID靶向特异性的分子机制,为理解抗体多样性和淋巴瘤发生提供了新视角。

  23. Nature62

    2型免疫史训练肺巨噬细胞产生病毒疾病耐受性

    研究发现2型炎症可训练神经和气道相关巨噬细胞,使其在不增强病毒清除的情况下,通过限制免疫病理和促进组织修复来抵御致死性流感,从而赋予疾病耐受性。

    推荐理由:研究揭示了2型免疫反应训练巨噬细胞产生疾病耐受性的新机制,为理解宿主防御与免疫病理的平衡提供了新视角。

  24. Nature69

    高糖饮食加剧抗生素诱导的肠道菌群紊乱并增加血液肿瘤患者死亡风险

    在173名接受异基因造血细胞移植的血液肿瘤患者中,研究发现摄入高糖食物与广谱抗生素暴露协同降低肠道菌群α多样性,并促进肠球菌扩增。每增加100克糖摄入,抗生素暴露期间的菌群α多样性额外降低24.1%。在糖摄入较高的患者中,抗生素暴露时长与死亡风险相关(HR=1.12,95% CI 1.01-1.23)。小鼠实验证实蔗糖可加剧抗生素诱导的肠球菌扩增。

    推荐理由:研究通过高精度饮食记录与肠道菌群测序,揭示了糖摄入与抗生素在血液肿瘤患者中的协同破坏作用,为临床营养干预提供了机制依据。

  25. Nature56

    基因疗法 Otarmeni 获批治疗 OTOF 突变耳聋的研发历程回顾

    Nature 回顾了从 1990 年代 OTOF 基因发现到 2025 年 Otarmeni 成为首个获 FDA 批准用于听力丧失基因疗法的关键里程碑。CHORD 试验中 80% 的参与者在 24 周内听力改善,42% 恢复听力。文章详述了病毒载体 Anc80L65 克服基因尺寸难题、小鼠模型验证机制以及多国药企布局此领域的研发转折点。

    推荐理由:文章通过时间线梳理了从基础研究到临床获批的关键节点,帮助读者理解基因疗法开发中的技术障碍与突破路径。

9月30日周三
  1. bioRxiv Cancer Biology70

    RNA 剪接因子突变通过毒害蛋白复合物驱动髓系肿瘤发生

    研究对 62 名髓系肿瘤患者和 20 名健康供体进行长/短读长单细胞转录组(10X-ONT,n=21)和免疫表型分辨的低细胞蛋白质组分析,发现剪接因子突变在造血分化过程中以突变特异性方式使蛋白质-转录组动态解耦。

    推荐理由:研究结合长读长单细胞转录组和低细胞蛋白质组,揭示了剪接因子突变通过毒害蛋白复合物驱动肿瘤发生的新机制。

  2. bioRxiv Cancer Biology56

    内皮 AMBRA1 缺失导致血管失调促进早期黑色素瘤转移进展

    研究发现内皮细胞 AMBRA1 缺失导致血管功能障碍并促进黑色素瘤进展。TGFβ 配体诱导内皮细胞 AMBRA1 转录后缺失,激活细胞周期和代谢程序,同时抑制内皮连接和免疫支持通路。在 121 例非溃疡性 AJCC I/II 期黑色素瘤队列中,肿瘤内和瘤周血管 AMBRA1 缺失与转移进展显著相关。

    推荐理由:研究揭示了内皮细胞中 AMBRA1 缺失通过影响血管功能和免疫支持通路促进黑色素瘤转移的机制。

  3. bioRxiv Cancer Biology51

    p38α MAPK 和 Casein kinase δ/ϵ 双重抑制剂 TAK-715 治疗雄激素非依赖和紫杉醇耐药前列腺癌

    TAK-715 作为 p38 MAPK 和 Casein kinase δ/ϵ 双重抑制剂,在体外实验中显示出对紫杉醇耐药和侵袭性转移性去势抵抗前列腺癌(mCRPC)细胞系的疗效,单药或联合紫杉醇均可抑制癌干细胞样细胞。该药物通过线粒体介导的凋亡通路发挥作用,单细胞转录组分析显示其能消除导致癌干性、转移和耐药的亚克隆群体。