多数据库生物信息学分析揭示 MET 基因表达在胃癌中的预后价值、信号互作网络及免疫浸润特征
MET 基因在胃癌组织中的表达显著高于正常胃黏膜，且其高表达与较差的总体生存期和无进展生存期相关。蛋白互作网络分析显示 MET 与 EGFR、ERBB2、HGF 等 20 个关键蛋白存在相互作用，其相关基因在 ERBB 信号通路、同源重组等通路中显著富集。多种算法交叉验证表明 MET 表达与胃癌的免疫细胞浸润水平相关。
#原始研究
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今日 63 条bioRxiv Cancer Biology评分3232 Cell评分4444 肠道免疫调节代谢物对CAR-T疗法的相反作用
肠道微生物分类本身是CAR-T细胞疗法疗效的较差预测指标。特定的肠道免疫调节代谢物对CAR-T细胞功能和肿瘤控制产生相反作用，表明微生物代谢是预测和改善CAR-T细胞疗效的潜在靶点。
Cell精选评分5555 光开关 Cas12f 和聚焦超声实现体内基因编辑的非侵入性控制
研究人员开发了可通过单次 AAV 递送的光开关 Cas12f 系统，结合聚焦超声实现深部组织基因编辑的远程激活，无需手术或植入设备即可精确控制编辑的时空特异性。
推荐理由：通过聚焦超声实现深部组织基因编辑的非侵入性控制，为体内基因治疗提供了新的操作范式。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分1414 美国神经病学临床队伍普查：医师、医师助理与执业护士
基于 Veeva OpenData 数据库，研究团队完成截至 2025 年 3 月美国神经病学临床工作者统计，共纳入 24,950 人，包括 20,196 名医师、1,502 名医师助理（PA）和 3,252 名执业护士（NP）。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分2121 合并症加重 COVID-19 严重程度：阿尔及利亚一项分析与流行病学研究
阿尔及利亚塞提夫社区 12,932 名 COVID-19 患者的流行病学分析显示，糖尿病、心血管疾病和高血压显著增加重症风险，OR 分别为 2.89、1.50 和 1.34，糖尿病为最强预测因子。研究表明合并症显著加重 SARS-CoV-2 感染严重程度与死亡率，提示需根据当地基础病流行情况制定个体化诊疗策略。
Cell评分4444 Cargo crosslinking nucleates AP-1 lattice formation
冷冻电镜揭示，含有串联分选基序的货物可直接通过桥接AP-1复合体来促进高阶衔接蛋白组装。这一机制支持了高效的膜泡运输，并在斑马鱼模型中证实对神经元发育至关重要。
Nature Biotechnology精选评分5656 AI引导优化热稳定mRNA疫苗，实现37°C储存两月后保持生物活性
AGENT框架结合高通量实验与贝叶斯优化，可快速设计热稳定的固态mRNA疫苗。这些制剂在37°C储存两个月后仍保持完全生物活性，在啮齿类和非人灵长类动物中通过微针贴片引发与新鲜疫苗相当的免疫反应。
Nature Biotechnology评分33 作者更正：用于体内快速制造和释放CAR-T细胞的生物指令植入支架
作者更正了2022年发表于《自然-生物技术》的文章中图5b第“52”行存在重复小鼠图像的错误。该图的HTML和PDF版本现均已修正。
Nature Biotechnology评分4242 利用数据高效 AI 加速发现热稳定 mRNA–脂质纳米颗粒疫苗
一项研究利用数据高效的 AI 方法加速了热稳定 mRNA–脂质纳米颗粒疫苗的发现。该方法通过优化配方，提高了疫苗在高温下的稳定性，有望解决 mRNA 疫苗储存和运输中的冷链依赖难题。这项工作为开发更易分发的疫苗提供了新策略。
Nature Genetics精选评分5959 胚系同源重组缺陷影响TP53突变克隆造血在铂类和PARP抑制剂治疗中的适应性
研究表明铂类比PARP抑制剂更能驱动DNA损伤反应基因突变的克隆造血，而存在胚系同源重组缺陷突变会降低这些克隆的扩增速率。该研究发表于Nature Genetics，DOI:10.1038/s41588-026-02752-2。
推荐理由：研究比较了铂类和PARP抑制剂对DNA损伤反应基因突变克隆造血的影响，并发现胚系同源重组缺陷突变会减缓这些克隆的扩增速度。
Molecular Cell评分5151 ATM通过抑制PRIMPOL介导的病理性再引发来保护DNA复制免受内源性碱基损伤
Sommerova等人研究表明，共济失调毛细血管扩张突变（ATM）通过抑制PRIMPOL介导的病理性再引发，保护复制细胞免受内源性氧化碱基损伤的绕过。当ATM缺失时，复制后加合单链DNA缺口积累，导致对同源重组修复的依赖性增加，并驱动PARP过度活化和PARP抑制剂敏感性。
Nature Biotechnology评分00 靶向组织且适配大RNA载荷的脂质纳米颗粒增强体内基因组编辑
适配大RNA载荷和组织靶向的脂质纳米颗粒（LNP）可增强体内基因组编辑效率。该递送系统通过优化LNP拓扑结构和脂质组分，解决了大尺寸基因组编辑工具（如碱基编辑器和先导编辑器）的体内递送挑战。这一进展为基于CRISPR的疗法提供了非病毒递送平台。
Nature Reviews Drug Discovery评分4040 药物偶联物实现细胞表面载荷释放的“结合即释放”化学策略
Wen等人报道了一种名为“结合即释放”的药物偶联物化学策略，可在无需靶点内化的情况下实现细胞表面载荷释放。该策略在小分子-药物偶联物和抗体-药物偶联物中应用，并在肿瘤模型中展示了其治疗和诊断潜力。相关研究发表于近期的《自然》杂志。
Nature Medicine评分3232 EGFR T790M 胚系突变的谱系及其对非吸烟者肺癌风险的贡献
一项基于超300万人数据的研究揭示了EGFR T790M胚系突变的祖先历史及其在非吸烟者肺癌风险中的当前贡献。该研究克服了既往小型研究统计效力不足的局限，为理解非吸烟者肺癌的遗传易感性提供了新见解。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分3838 <think>
The user wants me to act as a senior biomedical editor and complete two tasks。
Nature Biotechnology评分4545 LC-1脂质纳米颗粒实现大尺寸基因编辑器在小鼠多组织的高效递送
筛选离子化脂质发现LC-1能形成增强内体逃逸的结构，解决了脂质纳米颗粒递送大尺寸基因编辑器mRNA时效率低下的问题。LC-1脂质纳米颗粒可在小鼠肝脏、肺和大脑中实现高效的基因组编辑。该研究为设计大载荷基因治疗递送系统提供了新策略。
bioRxiv Cancer Biology评分4747 犬胶质瘤空间分析揭示由不同细胞可塑性与免疫抑制模式定义的瘤内异质性生态位
对30例犬胶质瘤（CG）FFPE样本的空间分析显示，所有亚型均存在与不同上皮-间质转化（EMP）表型相关的异质性免疫抑制生态位。星形细胞瘤表现出更强的间质特征并与肿瘤相关巨噬细胞（TAM）募集相关，而少突胶质细胞瘤则显示出强烈的干细胞样特征并独特地上调FOXP3/LAG3/SNAI1三联体。该研究确立了CG作为研究人类胶质瘤免疫治疗反应的比较模型的潜力。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分3333 综合计算与实验鉴定靶向 ML-IAP 的新型抗白血病细胞增殖肽
研究通过分子对接从 59,319 条四肽中筛选得到靶向 ML-IAP 的 peptide-1，其 Kd 值低于 Smac 肽且具最优结合特征。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分1616 内蒙古医学生HPV与HPV疫苗知识及接种横断面调查
内蒙古2026年4月针对646名医学生的调查显示，HPV和HPV疫苗知晓率分别为93.6%和87.6%，但仅27.2%女性接种过HPV疫苗，男性因疫苗暂未稳定供应无接种记录。仅74.8%知晓HPV是宫颈癌主要病因，男性知识水平低于女性，家庭收入、父亲教育及疫苗知识是接种的主要影响因素。未接种者中61.4%男性和86.4%女性表示愿意接种，主要障碍为费用、自觉没必要、怀疑有效性及担忧不良反应。
NEJM评分00 血清素综合征
血清素综合征是一种由药物引起的血清素能活性过高的潜在危及生命的疾病。其临床表现可从轻度症状（如震颤、躁动）快速进展为重度表现（如高热、癫痫发作）。诊断主要基于临床病史和体格检查，及时识别并停用致病药物是治疗的关键。
文献与产业新闻（bio-brief）精选评分5050 血浆吲哚-3-丙酸为肠道菌群来源代谢物，与2型糖尿病及心血管代谢结局相关：人类抗生素干预证据
一项纳入2型糖尿病患者与健康对照的人类干预研究发现，血浆吲哚-3-丙酸（IPA）在T2D组显著降低，7天广谱抗生素治疗后两组血浆IPA均降至接近检测不到的水平，直接证明血浆IPA几乎完全源自肠道菌群。
推荐理由：研究用7天广谱抗生素清除菌群后血浆IPA降至接近检测不到的水平，为IPA几乎完全源自肠道菌群提供了直接人体证据。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分4040 用更长随访数据评估瑞典 TLV 肿瘤药物 HTA 报告中总生存期外推的一致性
对 2009–2019 年间 40 份瑞典 TLV 肿瘤药物 HTA 报告进行回顾，使用平均 54.2 个月的更长随访 OS 数据重新外推后，TLV 与厂家假设下的外推 OS 曲线 AUC 分别平均上升 8.8%（95% CI 5.2%–12.6%）和 10.9%（95% CI 6.9%–15.1%），约三分之一案例增幅超过 10%。
监管与产业情报（Pharma-Intel）评分5454 人抗生素干预研究显示血浆吲哚-3-丙酸源自肠道菌群并与2型糖尿病及心脏代谢结局相关
一项7天广谱抗生素人体干预研究显示，血浆吲哚-3-丙酸（IPA）几乎完全由肠道菌群产生。抗生素使用前IPA在2型糖尿病患者中水平更低且与较低T2D几率相关，并呈此前未见报道的与血糖变异度负相关；IPA相关菌种聚类在同一共丰度模块中但未包含已知产IPA菌种，提示血浆IPA受更广泛菌群结构影响。DOI: 10.1080/19490976.2026.2736321
The Lancet Oncology评分3535 全球基本抗癌药物应用与复杂基因组诊断需求相关性的回顾性观察研究
一项研究显示，在基本药物清单（EML）中，需要复杂基因组诊断的精准抗癌药物应用率较低，且在低收入国家的应用最为有限。该回顾性观察研究分析了不同GDP水平国家的药物应用差异。结果表明，仅将药物纳入EML可能不足以确保患者可及性，尤其在精准肿瘤学药物日益增多的背景下。
Nature Genetics精选评分5656 人肠道染色质可及性的单细胞分析揭示克罗恩病的调控程序并阐明遗传关联
本研究使用单细胞 ATAC-seq 绘制了克罗恩病患者和健康对照肠道黏膜的染色质可及性图谱，以表征与炎症和遗传效应相关的调控程序。研究揭示了疾病特异性染色质可及性模式，并阐明了遗传变异如何通过调控元件影响疾病易感性。
推荐理由：通过单细胞染色质可及性分析揭示了克罗恩病相关的调控程序，为理解炎症和遗传效应的机制提供了新视角。
Nature Cancer精选评分5353 中风通过钙信号减弱的肿瘤相关星形胶质细胞驱动胶质瘤进展
Lee 团队发现缺血性中风诱导产生一种钙信号减弱的星形胶质细胞群体，通过促进肿瘤相关巨噬细胞招募从而驱动胶质瘤侵袭。该发现基于临床前模型，发表于 Nature Cancer。
推荐理由：研究揭示了中风通过改变星形胶质细胞钙信号促进胶质瘤侵袭的新机制，为理解肿瘤与神经系统互作提供了实验证据。
medRxiv Oncology评分4242 MRI 引导的前列腺癌主动监测结果与膳食纤维可接受性：阿伯丁经验
一项对阿伯丁皇家医院 420 名主动监测（AS）前列腺癌患者的回顾性审计显示，MRI 引导路径组（n=198）的中位 AS 中止时间较活检优先路径组（n=222）更短（4.1 年 vs 5.6 年，log-rank p<0.01）。
Nature评分1818 Bat1K 项目基因组研究提示蝙蝠可能起源于欧洲
Bat1K 项目首阶段研究完成了103种蝙蝠的染色体级别基因组解析，提出蝙蝠可能起源于欧洲的新观点。该项目旨在为所有现存蝙蝠物种生成参考基因组，以解析其飞行能力、病毒耐受性及抗癌特性。同期，AlphaFold 数据库新增8000余个病毒蛋白二聚体结构，并推出大流行防范门户。
Nature Cancer评分00 解析人类癌症中复杂的突变现象词汇
研究界已识别出多种复杂的癌症基因组突变模式，包括染色体碎裂、染色质环化、kataegis以及APOBEC酶介导的突变簇。这些模式由不同的分子机制驱动，例如DNA修复错误、染色体分离异常以及APOBEC3A等酶在治疗压力下的活性。理解这些突变特征对于阐明癌症的演化机制和耐药性的产生至关重要。
Nature Genetics评分4545 Genome-wide mapping of common and rare variant effects on adiposity across childhood
全基因组分析识别出与儿童期肥胖相关的常见和罕见变异，其中ADCY3、CALCR、MC4R、MRAP2、POMC和MYH13基因的罕见蛋白编码变异在儿童中表现出比成人更强的效应。这些发现揭示了儿童肥胖的遗传基础存在独特的年龄特异性模式。
Nature Genetics精选评分4545 Euchromatin forms condensed domains with short active regions on the surface
结合 micro-C 和成像数据的模拟揭示了从核小体到簇再到结构域的染色质组织一致性视图。结果显示，大多数常染色质区域形成紧凑结构域，但短调控元件高度暴露于表面。该研究为理解染色质三维组织提供了新视角。
Cell评分4343 Single-cell visual proteomics of a minimal bacterium reveals structural coordination of gene expression machineries
冷冻电子断层扫描技术解析了一种最小细菌中近乎完整的翻译过程，揭示了转录、翻译和膜结合等基因表达机制在细胞内的结构协调性。该研究在单细胞水平上对蛋白质进行了可视化和定量分析。
Cell精选评分5454 细胞内发现并表征非经典细菌蛋白转运-折叠复合物
研究人员利用细胞内冷冻电镜断层扫描结合蛋白质组学、整合结构建模和生物信息学，在最小细菌肺炎支原体中发现了一个连接 Sec 依赖蛋白转运与胞外折叠的复合物。该复合物能够同时支持共翻译和翻译后途径。
推荐理由：该方法整合了冷冻电镜断层扫描与蛋白质组学，可在细胞内直接发现未表征蛋白复合物，为细菌蛋白转运机制研究提供了新工具。
bioRxiv Genomics精选评分4848 Deconvolution of HIV-1 Mutational Signatures Reveals Dominant and Donor-Specific APOBEC3-Associated Mutagenesis Across Anatomical Compartments
对来自 Last Gift 快速尸检项目中 21 名 HIV 感染者的血液、脾脏、肠道和脑组织样本分析显示，APOBEC3 相关的突变特征占所有 HIV-1 env DNA 序列突变的约 50%。
Nature Biotechnology精选评分6161 光不稳定寡核苷酸结合拓扑光梯度实现空间分辨的单细胞转录组与表观基因组分析
研究团队开发了 scSTAMP-seq 方法，利用光不稳定寡核苷酸和数字微镜器件产生的拓扑光梯度，在单细胞水平上实现 mRNA、DNA 可及性和 DNA 甲基化的空间解析。该方法在人类 iPSC 来源的胃泌样体中验证了 CDX2、SOX17 等谱系标记基因的空间表达模式，并分析了染色质调节因子的分布。数据已存入 GEO（GSE237524），代码开源在 GitHub。
推荐理由：该方法通过光控寡核苷酸和拓扑光梯度实现了单细胞水平上转录组和表观基因组的同时空间解析，为研究组织发育和疾病机制提供了新工具。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6565 沈柏用/Florent Ginhoux团队揭示组织驻留巨噬细胞通过构建硒保护生态位维持胰腺癌侵袭性
研究发现富集于肿瘤边界的组织驻留巨噬细胞能够向高侵袭性的胰腺导管腺癌细胞提供硒蛋白Selenop，协助其逃避铁死亡并维持侵袭状态。这一发现揭示了免疫细胞作为营养和代谢物质供体，直接维持恶性肿瘤细胞特定侵袭状态的新肿瘤微环境代谢支持模式。
推荐理由：该研究揭示了巨噬细胞通过提供硒蛋白支持肿瘤细胞抵抗铁死亡的新机制，为理解肿瘤微环境的代谢支持功能提供了新视角。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6161 Nature：PHGDH缺失胰腺癌诱导肝细胞丝氨酸合成促进肝转移
Nature研究揭示胰腺导管腺癌肝转移新机制：PHGDH缺失肿瘤细胞无法自主合成丝氨酸，通过诱导邻近肝细胞上调PHGDH表达并激活丝氨酸合成通路来支持自身存活增殖。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6060 浙江大学王福俤团队在《Nature》发表铁死亡调控新靶点MFF的研究
浙江大学团队在《Nature》发表文章，解析线粒体-过氧化物酶体协同调控铁死亡的机制。研究借助磷酸蛋白组初筛锚定MFF，并进行了从组学到体内药效验证，为肿瘤铁死亡研究提供靶点筛选范式。
推荐理由：文章提供了一个从磷酸蛋白组初筛到体内药效验证的靶点筛选范式，可供一线肿瘤铁死亡研究参考。
中文产业新闻（药渡 / pharmcube）精选评分6262 单细胞多组学揭示大脑不同细胞类型与脑区的衰老轨迹不同步
一项发表于 Cell 的研究通过单细胞多组学分析发现大脑衰老并不同步。研究构建了包含超过13万个单细胞的DNA甲基化图谱和超过7万个细胞的三维染色质构象图谱，显示少突胶质细胞前体细胞和少突胶质细胞中的年龄相关差异甲基化区域明显多于神经元。
Science评分00 二维可扭转材料数据库
Science 期刊发布了一个二维可扭转材料数据库。该数据库收录了理论预测的可通过层间扭转调控其电子特性的二维材料体系。这一资源旨在为探索莫尔超晶格物理和设计新型量子材料提供系统的理论支持。