新技术、工具、数据集与图谱，以及会让既有数据打折的方法学发现。
研究团队通过原位冷冻电镜断层扫描和子断层图平均技术，以亚纳米分辨率解析了人类多纤毛上皮细胞中过渡区特异性双微管结构，鉴定出 9 个组成蛋白。发现 ECT2L 和 DZANK1 形成相邻双微管间的主要连接复合物，这两个基因的双等位基因功能缺失变异会导致原发性纤毛运动障碍。缺陷模型显示过渡区结构破坏、微管异常和纤毛尖端球状膨大，并损害黏液纤毛清除功能。
推荐理由：通过原位冷冻电镜断层扫描技术解析了人类纤毛过渡区的分子结构，并首次将 ECT2L 和 DZANK1 基因缺陷与原发性纤毛运动障碍直接关联。
Schiffers等人提出N4-乙酰胞苷（ac4C）可作为mRNA药物中N1-甲基假尿苷的替代性化学修饰，能进一步增强蛋白质产量。该发现扩展了设计下一代mRNA药物的可用化学工具库。
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皮肤生理药代动力学（PBPK）模型通过机制性表征经皮吸收过程来预测局部和全身暴露，并借助虚拟临床试验提升研发效率。
研究团队开发了一种非手术性尾静脉导管术，可在短暂异氟烷麻醉下数分钟内完成，实现清醒自由活动小鼠的多小时示踪剂输注。使用U-13C6-胱氨酸输注时，该方法实现了与颈静脉输注相当的稳健半胱氨酸标记和下游标记，同时维持循环胱氨酸池更接近生理水平。
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研究者开发了3DEEP组织透明化方法，通过去除基因组DNA实现对完整组织数百微米深度的空间转录组分析。将该技术应用于新生小鼠皮肤，通过对毛囊按分子推断的发育年龄排序，将单次空间快照转化为器官发生的四维分子图谱。
推荐理由：该方法通过单次空间快照推断发育时间，为研究其他器官形成过程提供了可迁移的技术路线。
一项结合表面增强红外吸收光谱与机器学习分子动力学的集成实验-计算框架，直接解析了氢析出反应（HER）条件下电化学双层（EDL）的分子结构与动力学。该研究揭示了内层的非线性两相演化过程，其会增强局部电场，并发现循环电位调制期间界面水发生了不可逆的重构。这些发现表明离子与界面水在远非平衡条件下异步响应，为理解静电势变化、离子界面电致收缩及合理电解质设计建立了定量分子框架。
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研究团队通过将蛋白质编码序列附加到16S rRNA上，构建了嵌合信使-核糖体RNA（mrRNA），该mrRNA可组装成小亚基并与大亚基结合形成Ribo-M核糖体，能够翻译mrRNA编码的蛋白质。通过突变或抗生素破坏小亚基功能可消除翻译，证明翻译由组装在嵌合mrRNA上的核糖体顺式执行。将mrRNA整合到亚基相连的核糖体中产生Ribo-TM，实现了编码、解码和肽合成在单一RNA支架上的统一。
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研究者开发了效应蛋白ORFeome（eORFeome）平台，包含来自病毒、细菌和寄生虫的3835个效应蛋白ORF。通过高通量条形码筛选NF-κB、凋亡、p53、cGAS-STING和MHC-I等通路，发现了数百个未表征效应蛋白的新功能。
推荐理由：该平台覆盖了3835个效应蛋白，为系统研究病原体与宿主相互作用提供了可扩展的功能基因组学工具。
研究人员开发了一种将蛋白质降解转化为转录输出的合成生物学方法，称为比率式转录激活。该方法通过控制转录因子与其抑制剂融合的蛋白质之间的比例，能够高灵敏度地检测蛋白质丰度变化。该电路可在单细胞或多细胞池中实现，独立于蛋白质下调机制，并能通过细胞存活、荧光蛋白表达或条形码测序等输出同时检测多个蛋白质下调事件。该方法可应用于致癌靶点并促进新分子胶降解剂的发现。
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研究团队通过从头蛋白质设计生成了三种细胞可渗透染料的小型、纳摩尔亲和力、高选择性结合物（NovoTags）。NovoTags的荧光寿命可调，并应用于寿命和波长多重荧光成像。还设计了双链版本（NovoSplit），在活细胞中作为化学诱导二聚化系统，或在固定细胞中作为最小干扰的邻近探针。该方法结合了荧光蛋白和染料的优势，扩展了细胞成像工具包。
推荐理由：通过从头设计蛋白质结合小分子染料，该方法结合了基因编码的便利性和染料的亮度优势，可用于活细胞和固定细胞的多重成像。
研究发现RNA靶向CRISPR系统的敲低效率常用RT-qPCR测量时，gRNA会在RNA提取过程中共纯化并抑制RT-qPCR，导致对gRNA结合位点及其上游扩增子的敲低效率系统性高估。作者建议使用具有强链置换活性的逆转录酶和正交方法以确保RT-qPCR的准确定量。
推荐理由：原文揭示了RT-qPCR测量RNA靶向CRISPR敲低效率的系统性高估问题，并提出了使用强链置换活性的逆转录酶和正交方法确保准确性的建议。
研究发现噬菌体T7激酶T7K是一种超混杂双特异性激酶，可在感染期间磷酸化几乎所有宿主和噬菌体蛋白。这种大规模磷酸化使T7K能够广泛灭活以DNA为靶点或含有DNA的细菌防御系统，包括通过特异性磷酸化事件削弱Retron-Eco9防御系统。
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EMA 启动了一项新的自愿数据提交试点，旨在促进新方法学生成的数据共享。该试点为企业和研究机构提供了一个独立于上市申请、非约束性的框架，以提交和讨论 NAM 数据，从而帮助监管机构积累经验并评估其科学价值。提交将持续至 2027 年第三季度，试点结束后将发布经验总结报告。
研究团队开发了自动化遗传 tRNA 扩展（AGENTEX）方法，用于在无细胞翻译系统中进行遗传密码的多重机器人原型构建。他们发现 tRNA 3' 末端对突变具有显著灵活性，大多数非 CCA-3' tRNA 可被大肠杆菌氨酰 tRNA 合成酶氨基酸化。
推荐理由：研究揭示了 tRNA 3' 末端突变对氨基酸化的广泛耐受性，为设计非天然遗传密码提供了可扩展的自动化方法。
研究开发了一种将目标蛋白与抗CRISPR偶联的方法，通过Cas转录因子将蛋白降解转化为可编程的转录输出。该系统通过调节抗CRISPR-Cas比例来调控对蛋白损失的敏感性，并可多重组合用于高通量发现蛋白降解和去稳定分子。
推荐理由：通过抗CRISPR与Cas的比例调节对蛋白损失的敏感性，为高通量筛选蛋白降解分子提供了可编程的转录输出系统。
研究团队开发了基于发光反应的超分辨率成像框架RIED，通过熵加权相关与反卷积结合实现约100纳米分辨率。该方法成功应用于细胞内细胞器的电化学发光、化学发光和生物发光超分辨率成像，并实现了41小时超长时程活细胞线粒体转移动力学连续成像。
推荐理由：该方法无需外部激光激发即可实现约100纳米分辨率，支持41小时超长时程活细胞成像，为光敏感样本提供了新选择。
研究人员开发了一种由聚两性离子和靶蛋白配体组成的可回收嵌合体McR-TAC，通过巨胞饮作用以受体非依赖性方式降解细胞膜和胞外蛋白。该嵌合体在酸性内吞区室中与靶蛋白解离，并通过内质网-高尔基体转胞吞途径被排出细胞，从而启动新一轮降解。在三阴性乳腺癌小鼠模型中，McR-TAC可持续降解PD-L1或MIF蛋白并抑制肿瘤生长。
推荐理由：该研究通过巨胞饮介导的可回收机制，解决了LYTAC技术对受体依赖和不可回收的限制，为靶向蛋白降解提供了新思路。
研究团队开发了供体互补型引物编辑（DoPE），该方法结合3'-突出双链DNA供体、一对突出互补的引物编辑向导RNA和PE2*引物编辑器，可在避免双链断裂的情况下精确插入长达12.5 kb的DNA序列。
推荐理由：该方法避免了双链断裂，支持单步插入长达12.5 kb的DNA片段，为基因编辑提供了新的文库兼容性工具。
研究者开发了名为 Prime Assembly (PA) 的可编程基因替换工具，利用 prime editing 在基因组和供体 DNA 上产生 3'-flap 实现精确退火。