Rb驱动的转录限制其在乳腺癌中的肿瘤抑制效应
CDK4/6抑制剂激活的Rb蛋白在激素受体阳性乳腺癌中不仅抑制细胞周期基因,还促进雌激素响应基因表达。这种Rb驱动的转录程序在ESR1突变耐药环境中持续存在,限制了CDK4/6抑制剂的疗效。研究还发现KDM5A与Rb的相互作用在此过程中介导基因调控。
推荐理由:研究揭示了CDK4/6抑制剂激活的Rb蛋白在乳腺癌中具有促增殖的转录功能,这解释了其在ESR1突变耐药场景中的疗效限制。
CDK4/6抑制剂激活的Rb蛋白在激素受体阳性乳腺癌中不仅抑制细胞周期基因,还促进雌激素响应基因表达。这种Rb驱动的转录程序在ESR1突变耐药环境中持续存在,限制了CDK4/6抑制剂的疗效。研究还发现KDM5A与Rb的相互作用在此过程中介导基因调控。
推荐理由:研究揭示了CDK4/6抑制剂激活的Rb蛋白在乳腺癌中具有促增殖的转录功能,这解释了其在ESR1突变耐药场景中的疗效限制。
研究设计了优化的表观遗传调节剂 EpiReg,在食蟹猴中通过单次 LNP 递送实现 PCSK9 的高效(>90%)和持久(343 天)沉默,并降低 LDL-C 水平。多组学分析显示 EpiReg-T 在猴、鼠和人源细胞中脱靶效应极小。该平台可通过改造 DNA 结合域重定向至其他基因。
推荐理由:研究在非人灵长类中验证了单剂量即可实现长期基因沉默,为表观遗传编辑的临床转化提供了体内数据。
本文是对发表于《自然》期刊的论文“组蛋白3赖氨酸27去甲基化酶在急性淋巴细胞白血病中的相反作用”的作者更正。更正内容涉及作者Panagiotis Ntziachristos和Aristotelis Tsirigos的同等贡献者声明,并更新了部分作者的单位信息。
研究发现基因组区域可通过酸性转录因子(AADs)自主定位到核斑附近,增强基因表达和剪接效率。通过分析COL1A1-SGCA基因座,鉴定出包含17个转录因子结合模体的600bp片段,其中四种酸性激活结构域具有染色质环境和转录依赖的核斑靶向功能,部分还具有转录独立的靶向活性。
推荐理由:研究揭示了酸性转录因子通过转录依赖和非依赖机制调控基因组定位的新机制,为理解核斑在基因表达调控中的作用提供了新视角。
焦亡相关 lncRNA 可调控乳腺癌进展并塑造肿瘤免疫微环境。低风险肿瘤显示 CD8+ T 细胞、NK 细胞和 B 细胞浸润增加及免疫检查点表达升高,而高风险肿瘤则呈现 M2 巨噬细胞富集和更高肿瘤突变负荷等免疫抑制特征。这些 lncRNA 通过炎症小体激活、gasdermin 介导的信号传导和表观遗传调控影响焦亡,具备作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力。
研究结合单分子足迹法与长读长测序,在果蝇基因组中量化了染色质可及性和转录因子结合在顺式调控元件间的共现频率。分析显示,顺式调控元件形成了具有共享单分子染色质可及性谱的特异性网络,且共可及性常见于通过染色质环化而靠近的远端元件之间。共可及的顺式调控元件在其细胞类型特异性可及性上表现出强协调性,表明协调的增强子激活是调控基因表达的广泛机制。
BRD4作为抗癌、抗病毒和抗炎反应的重要治疗靶点,其功能已从转录和表观遗传调控扩展至其他分子与生物学过程。对BET蛋白作用机制的深入理解不仅推动了多种溴结构域结合化合物进入临床试验,还催生了靶向磷酸化BRD4固有无序区的新型小分子抑制剂,该抑制剂可通过改变特定蛋白质相互作用网络来显著减少脱靶效应。
研究揭示了核应激体(nSBs)调控温度依赖性 pre-mRNA 剪接的多层热感应机制。在热应激恢复期,CLK1 的 Ser341 磷酸化状态决定其向 nSBs 的定位,该位点由 PP1 去磷酸化并由 RIOK2 再磷酸化。PPP1R2 被鉴定为可逆热传感器,在应激下解离以激活 PP1。
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研究对妊娠中期人新皮层的四种主要胶质细胞群体进行了三维表观基因组分析,整合了基因表达、染色质可及性、DNA甲基化和3D染色质互作数据。通过机器学习优先确定了112个精神分裂症风险变异位于胶质细胞cCREs中,并在体内验证了rs4449074风险等位基因对vRG增强子的破坏功能。
推荐理由:研究整合了多组学数据并验证了精神分裂症风险变异的功能,为理解人类皮层发育中的细胞类型特异性调控提供了三维表观基因组资源。
研究发现METTL3是CDK1的直接底物,其Ser43位点磷酸化在有丝分裂起始时被诱导,并通过m6A甲基化7SK RNA释放P-TEFb,从而促进RNA聚合酶II的全基因组清除和及时的有丝分裂进程。METTL3 Ser43内源性突变或破坏7SK甲基化会损害延伸动力学,延迟有丝分裂退出并增加染色体错误分离。
推荐理由:该研究将RNA甲基化修饰与细胞周期核心激酶网络联系起来,为理解有丝分裂中转录延伸的调控提供了新机制。
研究通过小鼠胶原诱导关节炎模型发现转录因子ZNF24在滑膜Tc17和Tc17.1细胞中高表达。ZNF24敲低降低了IL-17A、RORγt、GM-CSF等因子表达,并减弱了Tc17细胞诱导滑膜成纤维细胞产生促炎介质的能力。过继性转移ZNF24敲低的Tc17.1细胞可减轻关节炎发展,在人类RA患者样本中也观察到类似表达模式。
推荐理由:研究通过敲低实验和过继性转移验证了ZNF24在Tc17细胞促炎功能中的调控作用,为类风湿关节炎的炎症机制提供了新视角。
研究构建了TranslAGE数据库,整合51项纵向干预试验数据,计算了16种表观遗传时钟和94种其他DNA甲基化生物标志物对干预的响应性。发现预测死亡率或衰老速度的时钟响应最强,药理学和生活方式干预驱动最显著的DNAm变化,研究人群特征和持续时间是影响响应性的关键因素。可解释时钟比单分数时钟提供更具体的机制见解,有助于未来试验设计最小化多重检验和样本量。
推荐理由:研究整合了51项干预试验的数据,比较了16种表观遗传时钟对长寿干预的响应模式,为未来临床试验设计提供了具体参考。
TRPA1离子通道孔结构域中的一个单氨基酸突变,在合弓类与双孔类动物分化时改变了其热敏感性。在卵生脊椎动物胚胎中,阻断热激活的TRPA1会损害背根神经节轴突生长、破坏髓鞘形成并导致幼体肢体无力。TRPA1介导的Ca2+内流触发SP1核转位,从而激活CADM1和MDGA1,揭示了该通道在热适应中意想不到的发育作用。
表观遗传机制在心血管系统的发育、稳态维持及疾病发生中扮演关键角色。该领域研究揭示了染色质重塑、组蛋白修饰和非编码RNA等在心脏细胞命运决定和病理重塑中的调控作用。深入理解这些机制为心血管疾病的预防和治疗提供了新的潜在靶点。
研究对30例费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤患者进行纵向全基因组和靶向测序,整合克隆动态与7986次血常规和临床病史。不同的进化模式区分了稳定与进展性疾病,白血病转化通过TP53缺失、复杂克隆内逐步获得驱动突变或独立白血病克隆出现。
推荐理由:研究通过纵向全基因组测序揭示了骨髓增殖性肿瘤向白血病转化的不同基因组进化路径,为高风险患者的早期识别提供了依据。
人类核糖体组研究发现,DNA嵌入核糖核苷酸在启动子相关调控元件处积累并与转录活性成正比。RNase H2和Top1处理这些核糖核苷酸以调节DNA超螺旋,揭示了一种先前未被认识的转录相关表观遗传机制。