顶刊原始研究论文：机制、转化与队列。
研究发现朊蛋白自组装可切换酿酒酵母 DNA 修复与重组蛋白活性，形成可跨代遗传的突变开关，在强选择压力下提供短期适应性优势。在与酿酒酵母分歧约 3 亿年的白色念珠菌 WHO 优先病原体中，朊蛋白遗传的关键调控因子加速了氟康唑耐药的快速出现，提示蛋白自组装可作为跨代表观遗传记忆，调控基因组多样化以应对环境压力。
推荐理由：在酿酒酵母与白色念珠菌中，朊蛋白自组装作为可跨代遗传的突变开关，为病原体快速获得氟康唑耐药提供了机制解释。
作者用深度学习在 Eterna 竞赛中完成 57 个 RNA 假结的从头设计，AI 生成方法在多数盲测挑战中与有经验的人类设计者水平相当。生成结构经单核苷酸分辨率化学图谱、补偿突变和冷冻电镜验证，并能形成稳定的三维折叠。所用 RNet 基础模型基于既往化学图谱数据训练，提示部分困难 RNA 设计任务或可不依赖先解决三维结构预测。
推荐理由：原文展示了在不解三维结构预测条件下用化学映射数据训练模型完成 RNA 假结从头设计的完整流程，可作为类似 RNA 设计任务的流程参考。
研究通过大规模平行报告实验扫描约20万段、来自297个脊椎动物病毒属的基因组区段，鉴定出多类通过TENT4介导混合加尾增强RNA稳定性与翻译的元件，分布于19个病毒属、归为6个亚类，提示存在广泛趋同进化。原文还发现来自Potamipivirus的Pt1元件可招募经典poly(A)聚合酶PAPγ/α，将线性mRNA稳定性提升至与环状RNA相当的水平，指出其在RNA治疗工具开发中具有潜在应用价值。
推荐理由：该研究覆盖297个病毒属构建RNA元件功能图谱，并发现Pt1可将线性mRNA稳定性提升至与环状RNA相当的水平，为RNA治疗工具筛选提供新候选。
本研究解析了BRD4短亚型（BRD4-S）与H4双乙酰化核小体复合物的冷冻电镜结构，发现BD1同时结合H4尾和核小体DNA，并把乙酰化尾留给其他染色质蛋白读取。生化实验进一步显示BRD4在bromodomain之外的碱性区可不依赖组蛋白乙酰化紧密结合核小体，H4乙酰化则改变BRD4/核小体复合物的构象。DOI：10.1016/j.molcel.2026.07.012
推荐理由：原文给出BRD4-S与双乙酰化核小体复合物的冷冻电镜结构，揭示BD1同时接触H4尾与核小体DNA，并提示bromodomain之外碱性区可不依赖乙酰化结合核小体。
研究人员提出 DANDELION 框架，整合 trans 调控效应与全外显子测序的基因负担，在哮喘中识别出常规方法漏掉的疾病近端基因（DPG）。CRISPR 筛选在上皮细胞和 T 细胞中验证了多数 DPG 调控哮喘相关表型，SLC27A3 和 SCD 缺失在小鼠过敏性哮喘模型中影响炎症和气道重塑。
推荐理由：DANDELION 把 trans 调控与外显子负荷整合为中介分析框架，可推广到其他复杂疾病做靶基因排序。
Carvalho等人发现膀胱癌中存在由EMT样CD44高表达癌细胞与SPP1/PARP14高表达巨噬细胞配对形成的空间组织化生态位，该生态位驱动化疗耐药。抑制PARP14可将此保护性生态位转变为炎症状态并增敏顺铂。
推荐理由：研究揭示了肿瘤-巨噬细胞空间生态位通过PARP14介导化疗耐药的机制，并提示了靶向干预的可能性。
对鼠诺如病毒进行全基因组RNA结构图谱绘制，发现破坏特定结构域会损害病毒在细胞和体内的复制能力。这种结构破坏产生了遗传稳定的病毒，能在体内引发保护性免疫，为RNA病毒疫苗设计提供了理性策略。
推荐理由：通过破坏病毒RNA结构域来构建减毒活疫苗，为其他RNA病毒的疫苗设计提供了一种可推广的理性策略。
研究通过整合空间多组学，鉴定出由CD70+ ILC2和Tpex细胞组织的干细胞样淋巴生态位（SLNs），该生态位可预测肝细胞癌（HCC）对PD-1/PD-L1免疫疗法的反应。研究发现蜡样芽孢杆菌-PI-PLC能增加SLN丰度，并与PD-L1阻断产生协同作用，揭示了微生物群通过SLNs在HCC中治疗性增强癌症免疫疗法的潜力。
推荐理由：研究通过空间多组学识别出可预测免疫治疗应答的细胞生态位，并揭示了特定菌群成分的协同增效机制。
该研究确定 cMAF 是协调脑周血管巨噬细胞与动脉之间分子交流的关键转录因子，从而在健康和疾病状态下维持脑血管功能。
研究发现LRRK2的ROC GTPase作为核苷酸依赖性分子开关调节其激活和自抑制，并揭示了部分帕金森病突变如何破坏这一调控开关。