北京大学伊成器课题组与合作者在Nature发表ContactSeek框架,借助AlphaFold3接触概率赋能精准碱基编辑
北京大学伊成器课题组与合作者在Nature发文,开发了基于AlphaFold3接触概率的AI框架ContactSeek,用于系统识别碱基编辑器中决定编辑特异性的关键氨基酸残基。研究整合AlphaFold3预测的接触概率与高通量测序获得的脱靶编辑信息,据此对Cas蛋白和脱氨酶进行工程化改造,显著提升了编辑特异性,为基因编辑工具的精准设计提供了新范式。
推荐理由:该工作把AlphaFold3接触概率与高通量脱靶数据耦合的思路可迁移到其他碱基编辑器或Cas蛋白的特异性改造。