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单细胞与空间组学

单细胞、空间转录组与多组学图谱:新技术与它们回答的生物学问题。

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9月3日周四
  1. 顶刊论文(社媒热度)47

    大五人格特质全基因组关联分析揭示其遗传结构稳健且广泛相关

    一项涵盖46个队列、61.1万至114万参与者的荟萃分析鉴定出1260个与Big Five人格特质相关的先导遗传变异,其中824个为新发现。常见遗传变异解释了每个特质4.8-9.3%的方差,且遗传关联在不同地理、报告者和年龄组间高度一致。多基因指数分析和孟德尔随机化表明人格特质与 consequential behaviours 和 life outcomes 存在广泛的潜在因果关联。

    推荐理由:热度:X 浏览 29 万

9月2日周三
  1. 顶刊论文(社媒热度)52

    跨物种纹状体单细胞图谱揭示细胞类型和亚区疾病脆弱性

    研究通过109个人类和22个小鼠样本的单核RNA测序,构建了纹状体亚区神经元特化的全面图谱。定义了罕见的神经元亚群和沿背外侧-腹内侧轴的转录梯度,并发现物种间存在显著差异。整合全基因组关联和药理学研究,识别了人类富集的阿片受体表达位点和腹侧偏向的慢性抗精神病药物作用位点。配对的单细胞转录组和体细胞三核苷酸重复扩展测量揭示了亨廷顿病中亚区和神经元亚型的脆弱性差异。

    推荐理由:通过跨物种单细胞图谱揭示了纹状体细胞类型和亚区在神经退行性疾病中的差异脆弱性,为靶向治疗提供了新方向。

9月1日周二
  1. Cancer Discovery57

    乳腺癌和前列腺癌中癌前向癌转变的空间图谱

    研究利用光片显微镜和整合体积重建与空间转录组学的多模式连续切片工作流程,分析了51例患者的319个空间检测数据,揭示了癌前病变向浸润性疾病转变的基因表达特征和结构特征。在乳腺癌中,MGP和PLAT的缺失与浸润转变相关;在前列腺癌中,GDF15、ALDH1A3、ANPEP和FASN的上调与浸润进展相关,敲低这些基因可抑制PC-3细胞的增殖和迁移。非三阴性乳腺癌的转变区域富集了肿瘤相关巨噬细胞。

    推荐理由:通过整合光片显微镜与空间转录组学,该方法可直接定位并分析癌前向浸润转变的驱动因素。

  2. Cancer Discovery61

    ORION-FISH 整合空间蛋白与染色体状态揭示浆液性卵巢癌早期拷贝数变化

    研究者开发了 ORION-FISH 方法,整合高plex组织成像与DNA-FISH工作流程,可在完整组织中同时检测染色体拷贝数变异和蛋白定义的细胞状态。应用于高级别浆液性卵巢癌及其前体病变,该方法揭示了MYC和CCNE1拷贝数增益的亚克隆异质性,以及这些变化与特定免疫微环境的关联。

    推荐理由:该方法在保留组织架构的同时整合了多组学信息,可用于研究其他肿瘤类型的早期基因组进化与微环境相互作用。