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原文
medRxiv Oncology· Pan, M., Chi, J., Zhou, M. Y., Bui, N., Ganjoo, K. ·· 16 天前评分51

肉瘤端粒生物学分析:TERT 扩增与 ALT 在去分化脂肪肉瘤中互斥并预测不良预后,遗传性较长端粒与脂肪肉瘤风险相关

Somatic and Germline Telomere Biology in Sarcoma: Telomere Maintenance Is Acquired at Liposarcoma Dedifferentiation, and Genetically Longer Telomeres Are Associated With Liposarcoma Risk

导读

作者基于 AACR Project GENIE 等 19 家中心 11,792 例肉瘤测序数据,系统描绘端粒维持机制的组织学分布:TERT 激活(8.8%)与 ATRX/DAXX 失活代表的 ALT(8.0%)在各亚型中互斥(OR 0.52,95% CI 0.29–0.92)。

深度解读

癌细胞要持续增殖,必须先解决端粒缩短的问题:绝大多数肿瘤依赖端粒酶,另有部分经由同源重组介导的ALT途径维持端粒,TERT启动子突变与ATRX/DAXX失活分别是这两条路线的代表性基因组事件[1],其中ATRX丢失更是ALT的标志特征[2]。在脂肪肉瘤,2006年一项93例的功能检测研究已经发现ALT多见于去分化及高级别病灶,且携带任何端粒维持机制的病例预后更差[4];一项覆盖60类、1230例肿瘤的调查还把脂肪肉瘤列入TERT启动子突变高发的九类肿瘤[3]。但各肉瘤亚型究竟如何选择端粒酶或ALT、由哪些具体事件驱动、临床意义如何,一直缺少按组织学分层的大规模刻画。

这项研究分析了AACR Project GENIE v20.0中19个中心11,792例肉瘤的测序数据,以TERT启动子突变、扩增或重排定义端粒酶激活,以ATRX/DAXX失活作为ALT的替代指标,并在TCGA中验证TERT表达、在MSK-IMPACT 50K中验证总生存、在Foundation Medicine队列中独立复现,再用FinnGen做孟德尔随机化检验胚系端粒长度。结果显示,端粒酶激活(8.8%)与ATRX/DAXX丢失(8.0%)跨亚型互斥(OR 0.52)并按组织学分隔。在MDM2扩增的去分化脂肪肉瘤(DDLPS)中,端粒酶经TERT扩增(17.2%)或重排(2.7%)激活,261例中无一例启动子突变,也从不伴ATRX/DAXX丢失(0/49,P=.011);TERT扩增的肿瘤确有TERT高表达(P=.002),且扩增多为局灶性。端粒维持改变见于28.0%的DDLPS,远高于高分化脂肪肉瘤(WDLPS)的8.7%(P<.001),并预示DDLPS总生存更差(HR 2.04)。ATRX/DAXX丢失在子宫较子宫外平滑肌肉瘤更常见(两队列OR分别为1.96和1.95,均P<.001)。遗传预测的端粒每延长一个标准差,脂肪肉瘤风险OR达4.10。

由于WDLPS与DDLPS由共同前体分歧演化并共享12q13–q15区扩增[5],28.0%对8.7%的悬殊差异把端粒维持的获得锚定在去分化这一步,而且途径是局灶性TERT扩增或ALT而非启动子突变——这与早年将脂肪肉瘤整体视为TERT启动子突变高发类型的调查形成对照,凸显了亚型与事件类型的特异性[3]。研究同时把功能检测时代小样本的预后线索[4]推进为万例级基因组证据,并为两种机制的互斥提供了跨亚型的统计学支撑。胚系层面,既往孟德尔随机化汇总分析已提示较长的遗传决定端粒很可能增加多种癌症风险[6],本研究在脂肪肉瘤中给出了更为突出的效应量。

当然,ATRX/DAXX失活只是ALT的替代指标而非直接功能验证,各中心检测panel对相关位点的覆盖差异也约束了事件判定;TERT扩增如何参与去分化过程、更长的胚系端粒经何途径抬高脂肪肉瘤风险,仍有待解答。

来源:medRxiv Oncology · medrxiv.org