炎症与纤维化调控逻辑的关联
免疫细胞与成纤维细胞作为细胞间信号的动态解读者，通过染色质调控的基因回路整合信号以决定细胞状态与命运。基于心脏生物学及无疤痕组织再生领域的见解，本文综述了免疫-基质细胞互作及基因调控网络如何决定器官在恢复与慢性纤维化之间的选择。将纤维化视为由调控逻辑紊乱塑造的可逆状态，为超越单纯抑制纤维化输出、转向重编程维持纤维化的调控程序开辟了治疗新途径。
#染色质/3D基因组
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今日 4 条顶刊论文（社媒热度）评分3636 顶刊论文（社媒热度）评分5757 Torsins 通过组织 CLCC1 组装来保护内质网膜和脂质稳态
研究发现 torsin ATPases 是 CLCC1 寡聚化的关键调控因子，驱动 CLCC1 在膜失衡位点招募以激活 TMEM41B scramblase，从而维持内质网膜脂质平衡。小鼠模型中肝脏 torsinA 失活会导致巨大脂滴形成和严重 MASH，而外源 CLCC1 表达可逆转脂质紊乱。
顶刊论文（社媒热度）精选评分6363 亚核基因组区室化控制二价染色质活性
研究绘制了人皮质神经发生过程中基因组与核纤层和核斑点相互作用的高分辨率图谱，发现数百个神经元基因从核周区迁移至核斑点。位于核周区的二价基因（H3K27me3和H3K4me3）表达极低，迁移至核斑点后其染色质分辨率提高至H3K4me3单价态，转录水平增加八倍以上。核周区的抑制环境与转录延伸机器的空间隔离相关，表明基因的空间位置对其表观遗传调控至关重要。
推荐理由：研究通过高分辨率图谱揭示了核周区与核斑点的空间分隔如何调控二价染色质基因的表达状态，为理解神经发育的表观遗传调控提供了新范式。
顶刊论文（社媒热度）精选评分5858 人类染色体复制后出现构象不对称性
研究发现人类姐妹染色单体在遗传DNA链的5'→3'方向上持续存在错位。这种错位在没有黏连蛋白介导的环挤压时仍然存在，但在黏连被破坏时消失。聚合模型显示黏连蛋白的适度方向性错位可以解释观察到的偏移，研究提出了两种模型解释这种错位如何源自复制叉不对称性。这种姐妹染色单体间的寄存器偏移对DNA修复过程中的同源搜索具有意义。
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顶刊论文（社媒热度）精选评分5959 发育中人皮层胶质细胞类型的三维表观基因组
研究对妊娠中期人新皮层的四种主要胶质细胞群体进行了三维表观基因组分析，整合了基因表达、染色质可及性、DNA甲基化和3D染色质互作数据。通过机器学习优先确定了112个精神分裂症风险变异位于胶质细胞cCREs中，并在体内验证了rs4449074风险等位基因对vRG增强子的破坏功能。
推荐理由：研究整合了多组学数据并验证了精神分裂症风险变异的功能，为理解人类皮层发育中的细胞类型特异性调控提供了三维表观基因组资源。
顶刊论文（社媒热度）精选评分4949 Brl1-Brr6 复合物介导核孔复合体组装的保守膜融合机制
Brl1 和 Brr6 在酿酒酵母中形成具有膜重塑活性的环状复合物，介导核孔复合体组装过程中的内外核膜融合。分子动力学模拟表明该复合物通过形成跨双层通道驱动脂质交换以实现膜融合。系统发育分析和功能实验证实 CLCC1 是后生动物中保守的核孔膜融合因子。
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顶刊论文（社媒热度）评分33 Author Correction: Structural mechanism of cGAS inhibition by the nucleosome
作者团队更正了2020年发表于Nature的cGAS抑制机制研究中的Extended Data Fig. 1d图像重复问题。该错误源于图片制备过程，不影响论文任何数据结论。更正后的图像已在文章HTML和PDF版本中更新。
顶刊论文（社媒热度）精选评分6565 人类增强子-基因调控互作百科全书
研究构建了覆盖1458个生物样本的超过9200万个增强子-基因调控互作资源，整合了ENCODE联盟的预测模型、染色质状态、三维接触和遗传扰动数据。开发了ENCODE-rE2G模型，在CRISPR扰动、eQTL和GWAS变异关联任务中表现优异，揭示了启动子类别和增强子协同等调控特征。
推荐理由：通过整合多种数据源和机器学习模型，提供了超过9200万个增强子-基因互作预测，为解析非编码变异在复杂疾病中的作用提供了系统资源。
顶刊论文（社媒热度）精选评分5757 基因组倾向性与性染色体进化方向相关
基于19种壁虎染色体级别基因组的研究发现，性染色体进化方向与祖先基因内容相关：睾丸富集区域倾向于演化为ZW系统，睾丸缺失区域倾向于演化为XY系统。该模式在多个羊膜动物性染色体起源中均被观察到。具有遗传性别决定的壁虎通过异配性别上调反复进化出部分剂量平衡。
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Cell评分5353 人类核糖体组揭示DNA嵌入核糖核苷酸作为转录相关DNA超螺旋的表观遗传调节因子
人类核糖体组研究发现，DNA嵌入核糖核苷酸在启动子相关调控元件处积累并与转录活性成正比。RNase H2和Top1处理这些核糖核苷酸以调节DNA超螺旋，揭示了一种先前未被认识的转录相关表观遗传机制。
Cell评分4949 Integrative spatial profiling of 3D genome organization and gene expression in tissue
Spatial Hi-C-RNA 技术可同时从同一组织样本中绘制三维基因组结构和基因表达图谱。该技术揭示了空间基因组组织如何塑造细胞身份、发育及肿瘤演化，其提供的信息超出了仅凭转录组学所能捕获的范围。
Cell评分4949 DDIAS 在有丝分裂中保护单链 DNA 并促进脊椎动物大脑发育
DDIAS 被鉴定为一种在有丝分裂过程中保护单链 DNA 以维持染色体稳定性的因子。DDIAS 的功能失活突变在一项人类神经发育障碍中被发现。该研究揭示了 DDIAS 在脊椎动物大脑发育中的关键作用。