bioRxiv Genomics· LeMay, S. W., Harpak, A. ·· 19 小时前精选评分59
Collapsed Site Coalescent(CSC)模型促进检测片段重复序列间的适应性分化
Collapsed Site Coalescent Facilitates Detection of Adaptive Divergences Between Segmental Duplicates
导读
LeMay与Harpak提出Collapsed Site Coalescent(CSC)模型,将每对旁系同源位点折叠为带独立系谱的伪位点,以支持片段重复序列的ARG推断。
推荐理由
CSC模型将成对旁系同源位点折叠为自带系谱的伪位点,模拟中估计的IGC参数接近真实值,并可识别受选择保护而免遭IGC抹除的适应性差异区域。
来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org
