性別与祖源对胰腺导管腺癌(PDAC)分子特征图谱的影响
The impact of sex and ancestry on the molecular landscape of pancreatic adenocarcinoma
整合 7,527 例胰腺导管腺癌样本的研究显示,非洲祖源者肿瘤 SNV 负荷高于欧洲祖源,亚洲祖源者则更低;GNAS 驱动突变在亚洲祖源中更常见,在非洲祖源中较少。KRAS 突变频率未发现性別或祖源相关差异,但部分 KRAS 变体呈现祖源相关趋势。结果提示祖源参与塑造 PDAC 基因组异质性,强调在分子分析中纳入多样化祖源。
胰腺导管腺癌(PDAC)发病率持续上升,预计将成为癌症相关死亡的第二大原因,5年生存率仅约10%。学界对其分子异质性的刻画已相当深入:整合基因组学确定了KRAS、TP53、GNAS等复发驱动基因[2];转录组分析划分出经典型、准间充质型等治疗反应各异的分子亚型[3];单细胞测序进一步揭示了瘤内异质性与恶性进展轨迹[4];癌前病变、驱动事件序列与微环境也被纳入统一的演化综述[1]。KRAS点突变见于逾90%的PDAC病例[5]。然而,这些图景大多建立在未经分层的队列之上,性别与祖源等个体遗传特征如何影响肿瘤异质性,一直缺乏系统答案;已有综述提示生物学性别可影响PDAC的发病率与死亡率、基因与表观遗传景观、抗肿瘤免疫及治疗反应[6],但基因组层面的直接证据仍有限。
为此,研究者汇集五个数据集共7,527例PDAC肿瘤,在全局层面(SNV密度、拷贝数事件改变的基因组比例)与基因层面(复发事件)评估基因组不稳定性,并分析KRAS变异频率、倍体与mRNA丰度;祖源在可获得生殖系基因型时以ADMIXTURE推断,否则采用患者自报。结果显示,全局点突变密度呈祖源特异性模式:与欧洲祖源肿瘤相比,非洲祖源肿瘤的SNV负荷更高,亚洲祖源更低;驱动基因GNAS亦存在祖源偏向,亚洲祖源中GNAS驱动SNV检出更频繁,非洲祖源更少。KRAS整体上与性别、祖源均无关联,但个别KRAS变异显示出随祖源变化的趋势。
这项工作把患者遗传背景纳入了PDAC基因组异质性的解释框架,表明祖源同时塑造全局与基因特异的突变模式。鉴于GNAS是PDAC复发驱动基因之一,其改变尤其见于KRAS野生型肿瘤[2],且KRAS与GNAS突变在PDAC和IPMN中更为常见[7],GNAS的祖源偏向若获证实,对分子诊断与靶向治疗的患者分层或有直接意义。不过,另一项PDAC临床基因组全景分析报告基因水平改变频率在不同性别或祖源组间无显著差异[8],与本文在GNAS上的结论并不一致,孰是孰非尚待更多队列检验。
还需指出,该研究目前以预印本形式发表、未经同行评审;KRAS变异的祖源关联仅为趋势性结果;祖源判定部分依赖患者自报;性别维度除KRAS无关联外亦少有阳性发现。祖源相关突变差异背后的机制,以及这些差异是否会转化为诊断效能与疗效的差异,仍是悬而未决的问题。
- 1.Pancreatic cancer evolution and heterogeneity: integrating omics and clinical data · Nat Rev Cancer 2022
- 2.Integrated Genomic Characterization of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma · Cancer Cell 2017
- 3.Subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and their differing responses to therapy · Nat Med 2011
- 4.Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma · Cell Res 2019
- 5.The Clinical Implications of KRAS Mutations and Variant Allele · pmc.ncbi.nlm.nih.gov 2026
- 6.Sex-Related Differences in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma · pmc.ncbi.nlm.nih.gov 2026
- 7.Differential expression of GNAS and KRAS mutations - PubMed · pubmed.ncbi.nlm.nih.gov 2026
- 8.Clinicogenomic landscape of pancreatic adenocarcinoma · nature.com 2026
来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org