跳到正文
原文
bioRxiv Cancer Biology· Shi, Y., Sharma, P., Lin, J.-r., Dedeilia, A., Taratino, G., Pelletier, R., Lopez, M. L., Aygun, N., Manos, M. P., Lawless, A. R., Cohen, S., Lu, Y. D., Roelofs, M. K., Pant, S. M., Chen, J., Fisher, D. E., Beroukhim, R., Lian, C. G., Buchbinder, E. I., Sorger, P. K., Insco, M., Liu, D., Boland, G. ·· 18 小时前评分53

黏膜黑色素瘤多组学分析划分出四个互斥基因组亚型并锁定 TIM-3 阻断方向

Genomic classification and immune profiling define mucosal melanoma

导读

研究团队对 339 例黏膜黑色素瘤患者进行多模态组学分析,将其分为 CDK4/MDM2/CCND1、SF3B1 突变、TP53/ATRX 与 Triple WT 四个互斥基因组亚型,各亚型对应不同解剖部位但预后相近。

深度解读

发生了什么

对339例黏膜黑色素瘤患者进行多模态分析后,研究者定义出四个互斥的基因组亚型:CDK4/MDM2/CCND1、SF3B1突变型、TP53/ATRX以及三阴型(Triple WT),这些亚型对应不同的解剖部位但临床预后相似。与皮肤型黑色素瘤相比,黏膜型表现出更大的基因组异质性与非整倍体增加、T细胞浸润减少而CD163+肿瘤相关巨噬细胞增多。CD163+巨噬细胞通过GAL9-TIM-3互作与非调节性T细胞接触,并在疾病进展和免疫治疗耐药过程中进一步累积。

为什么重要

该研究回应了黏膜黑色素瘤缺乏统一分子分型的问题——此前全基因组研究已识别NRAS、BRAF、NF1、KIT、SF3B1、TP53、ATRX等显著突变基因[1],但未形成互斥亚型框架;其中SF3B1 R625位点突变在黏膜型中独特存在,比例约为12.9%[2]。四个亚型预后相似,提示这一分子分类对预后分层的增量价值有限。对临床和BD读者而言,CD163+ M2型巨噬细胞驱动T细胞免疫抑制的机制[3]以及TIM-3与CD163共表达与不良预后相关的独立证据[4],从其他瘤种队列支持了本研究提出的TIM-3阻断策略,使其成为一个有外部佐证的可成药靶点。

还缺什么

材料未披露各亚型的总生存期、客观缓解率或无进展生存期,也未给出任何TIM-3抑制剂在黏膜黑色素瘤中的临床数据。四个亚型对抗PD-1或抗CTLA-4等现有免疫治疗的应答差异、CD163+巨噬细胞密度与免疫治疗反应的相关性,是判断TIM-3这一靶点是否真正可用的关键下一步。GAL9-TIM-3轴在不同亚型间是否一致、目前是否有针对该人群的TIM-3抑制剂试验计划,材料中均未披露。

来源:bioRxiv Cancer Biology · biorxiv.org

CBACBA Frontier Insights (CFI)美国华人生物医药科技协会(CBA)www.cba-usa.org