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原文
bioRxiv Cancer Biology· V, M., Koladiya, A., Thennavan, A., Yu, X., Lozano, G. ·· 15 小时前评分52

Trp53 杂合在 Kras 驱动非小细胞肺癌小鼠模型中定义新的肿瘤状态并影响进展

Trp53 heterozygosity defines novel states impacting tumor plasticity and progression in Kras-initiated non-small cell lung cancer

导读

作者构建了携带 KrasG12D 突变、Trp53 完整(K)或单等位缺失(KP+/-)的小鼠肺癌模型,并与已发表的 Trp53 完全缺失(KP)数据比较。K 与 KP+/- 小鼠生存长于 KP 小鼠,与临床数据一致;单细胞转录组分析显示 Trp53 杂合扩展了 K 与 KP 肿瘤中未出现的转录可塑性,KP+/- 基因组不稳定性高于 KP。

深度解读

KRAS突变约见于四分之一的非小细胞肺癌(NSCLC),但即便同为KRAS突变,患者临床进程也高度异质,共突变格局是解释这种异质性的主要维度:晚期KRAS突变肺癌中最常见的共突变依次为TP53(42%)、STK11(29%)与KEAP1/NFE2L2(27%)[1]。其中TP53与STK11/LKB1共突变可将KRAS突变肺腺癌划分为生物学特征与免疫治疗反应不同的亚组[2],这些共突变还会影响肿瘤增殖和免疫监视相关的表达程序[3]。不过,此类认识基本把TP53当作“有/无”的二元变量,而临床上TP53位点最常见的事件其实是单个等位基因突变或丢失、另一等位基因保留野生型,这种情况的预后好于完全丢失,但杂合状态的独立贡献在覆盖Trp53完整(K)与完全缺失(KP)两端的实验体系中一直难以拆解。

这项研究为此构建了携带KrasG12D、Trp53分别完整(K)与单等位基因缺失(KP+/-)的小鼠肺肿瘤模型,并与公开的完全缺失(KP)数据对照。K与KP+/-小鼠的生存均长于KP小鼠,与临床生存数据平行。对肿瘤负荷肺的单细胞转录组分析显示,Trp53杂合性扩展出K与KP肿瘤中均不存在的转录可塑性,且KP+/-的基因组不稳定性反而高于KP基因型。作者据此提出,Trp53基因剂量调控着肿瘤状态的表型可塑性与演化轨迹。小鼠KP+/-的肿瘤特征与拷贝数谱在人NSCLC数据集中均可找到对应,其中两个特征分别与患者较好和较差的生存相关。

相对于以往按共突变“分组”的研究路径[2][3],这项工作把TP53进一步细化为基因剂量维度:杂合并非完整与完全缺失之间的简单过渡态,而是一种具有独特可塑性与基因组景观的状态。考虑到在STK11/LKB1突变背景中,谱系可塑性已被证明可介导KRAS抑制剂耐药[4],识别出一群可塑性被扩大的基因型状态对治疗策略有直接提示——正如作者所言,KRAS突变肺癌中TP53杂合性呈现的独特基因组景观,应被纳入新型治疗策略的制定。

需要指出,这仍是一项预印本工作,结论有待同行评议与完整数据检验;杂合为何比完全缺失伴随更高的基因组不稳定性、可塑性扩展的机制为何、两个生存相关特征能否落地为治疗分层工具,均属尚未解决的问题。

来源:bioRxiv Cancer Biology · biorxiv.org