ARPA-H 拟以 AI 加速罕见病诊断,RAPID 项目新批四项资助近 8300 万美元
ARPA-H envisions faster rare disease diagnosis with AI
ARPA-H 旗下罕见病精准诊断 AI/ML(RAPID)项目新批四项资助,总额最高近 8300 万美元,用于开发罕见病早期诊断的 AI 工具及底层大规模数据集。RAPID 于 2024 年 12 月启动,计划 4.5 年内投入最高 9850 万美元,旨在缩短患者诊断时间并推动治疗开发。
罕见病的诊断素来是一场漫长的“奥德赛”。仅美国就有约3000万罕见病患者,全球逾3-4亿人受累,传统诊断高度依赖临床经验与文献检索的启发式方法,大量患者多年得不到确诊,部分甚至至死没有明确答案[1];患儿家长在医疗、教育、残障服务等多个系统间奔走,长期承受无诊断之苦[4]。测序技术带来了实质突破:基因panel、微阵列与外显子测序已能解开约25-35%未确诊患者的病因[1];英国10万基因组计划先导研究显示,疑为单基因病因者诊断率可达35%,而复杂病因者仅11%[2];澳大利亚急性护理基因组项目借助全基因组测序与多组学整合,将危重患儿家庭的总体诊断率推至54%[3]。但整体诊断率仍难令人满意,表型描述的异质性、噪声与专家知识利用不足是公认瓶颈[5];Xrare等机器学习方法通过联合建模表型与遗传证据,在多种诊断场景下较既有方法提升10-40%[5],既显示AI潜力,也折射出高质量数据与工具的匮乏。
正是在此背景下,ARPA-H于2024年12月启动“罕见病AI/ML精准整合诊断”(RAPID)计划,承诺4.5年内投入至多9850万美元,开发AI驱动的诊断工具及其赖以训练的大规模数据集。据最新消息,该机构现已据此发出四个新资助,总额至多近8300万美元,旨在支持研究者借助AI加速构建罕见病大数据集与AI工具,实现更早诊断并推进治疗研发。报道列出的相关机构包括亚马逊、Anthropic、FDNA、谷歌、劳伦斯伯克利国家实验室、NIH以及美国罕见病组织。
与既往努力相比,这一计划的着力点有所不同。此前的进展多发生在单个项目或单一算法层面——测序技术迭代[1]、国家级基因组计划[2]、危重场景的快速诊断流程[3]或表型-基因联合建模的优化[5],而表型噪声与知识利用不足等瓶颈依旧[5]。RAPID则将大规模数据集建设与AI工具开发并举,以国家层面的系统性投入直接瞄准数据瓶颈,并把更早诊断与治疗研发衔接起来。
不过,这仍是刚落地的资助布局,四个项目能否转化为临床可用的早诊工具、惠及多少病种与人群,有待时间检验。即便在条件优越的研究项目中,复杂病因罕见病的诊断率也仅11%[2],而诊断奥德赛对家庭的消耗,不会因技术承诺而自动消失[4]。
- 1.A guide for the diagnosis of rare and undiagnosed disease: beyond the exome · Genome Med 2022
- 2.100,000 Genomes Pilot on Rare-Disease Diagnosis in Health Care - Preliminary Report · N Engl J Med 2021
- 3.Integrated multi-omics for rapid rare disease diagnosis on a national scale · Nat Med 2023
- 4.The diagnostic odyssey: insights from parents of children living with an undiagnosed condition · Orphanet J Rare Dis 2022
- 5.Xrare: a machine learning method jointly modeling phenotypes and genetic evidence for rare disease diagnosis · Genet Med 2019
来源:文献与产业新闻 · biocentury.com