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bioRxiv 预印本· Xu, J., Guo, Z., Zhong, C., Yin, Q., He, Y., Chen, Z., Xin, H., Jin, P., Deng, P. ·· 16 小时前评分40

RegDesign-Bench:细胞类型特异性调控 DNA 设计计算方法基准评测

RegDesign-Bench: Benchmarking computational methods for cell-type-specific regulatory DNA design

导读

RegDesign-Bench 是一个用于系统评测细胞类型特异性顺式调控元件设计计算方法的标准化基准框架。测试发现,强预测活性并不总伴随细胞类型选择性可及性或相关 motif 信号,与参考序列分布相似也无法保证高目标细胞活性或特异性,表明单项指标优绩难以推广至所有调控属性与文库特征,方法选用应依具体设计目标而定。

来源:bioRxiv 预印本

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