Nature Medicine：uRARE-seq方法利用尿液cfRNA同时读出膀胱癌肿瘤、MRD与免疫状态

尿液生物标志物长期被视为膀胱癌无创检测的希望，但早期系统评价显示现有尿液标志物灵敏度仅 0.57–0.82、特异性 0.74–0.88 ^[1]，难以替代膀胱镜。随后基于尿液肿瘤 DNA（utDNA）的 uCAPP-Seq 将检出率推高至 84%–93%（特异性 96%–100%）^[2]，并在监测中展现出早于临床进展的优势，但后续研究发现随着年龄增长，正常尿路上皮的“田野效应”突变会显著干扰 utDNA 的特异性 ^[3]；同时，基于组织的分子亚型虽能预测 BCG 反应 ^[4]，却无法在无创层面实现同步检测与分层。这些局限使得领域亟需一种既能规避田野效应、又能同时捕捉肿瘤与免疫微环境信息的液体活检手段。

本研究开发了尿液随机引物与亲和捕获富集测序（uRARE-seq），对 683 份尿液样本的游离 RNA（cfRNA）进行谱系分析。结果显示，尿液 cfRNA 含有泌尿生殖组织转录本，在前列腺癌、肾癌及膀胱癌患者中均能检出肿瘤源性转录本。针对局限性膀胱癌，uRARE-seq 在 90% 特异性下达到 95% 灵敏度，优于同期尿液肿瘤 DNA 分析，且不受田野效应突变干扰。该方法还能敏感检测微小残留病（MRD），并能区分手术后与 BCG 膀胱灌注后的完全分子缓解状态。

更关键的是，预治疗尿液 cfRNA 揭示了 BCG 反应的生物学差异：完全缓解者样本富集 T 细胞及免疫相关特征，提示预存抗肿瘤免疫应答；无应答者则以增殖相关基因高表达为主。基于 114 例患者的预治疗尿液，研究据此构建预测 BCG 与化疗应答可能性的生物标志物，曲线下面积达 0.93，且与复发风险强相关。这表明 cfRNA 既能提供肿瘤负荷信息，又能反映宿主免疫状态，在单一检测中实现了诊断、MRD 监测与治疗选择的三重功能。

尽管 uRARE-seq 在回顾性队列中展现出优于现有尿液 DNA 方法的性能，并阐明了 BCG 反应的免疫相关机制，但其临床效用仍需前瞻性研究验证；此外，该技术在其他泌尿系统恶性肿瘤中的泛化性、标准化流程的建立以及成本效益评估，均是推向临床应用前必须解决的问题。