裸鼹鼠二倍体端粒到端粒基因组解码

裸鼹形鼠以其超过30年的最长啮齿动物寿命、极低的肿瘤易感以及真社会性繁殖体系，长期吸引比较生物学与衰老研究者的关注 ^{[1, 2]}。2011年的基因组测序初步揭示了若干独特的分子适应特征 ^[2]，此后陆续发布的多版参考基因组——例如Ensembl收录的Naked_mole-rat_maternal组装（GCA_944319715.1）^[5]——使研究得以在更连续的序列背景下展开，但端粒到端粒的完整组装此前仍付阙如。抗癌机制方面，研究多集中于翻译后层面，例如高分子量透明质酸的积累与信号通路 ^[3]；而后在表达裸鼹形鼠Has2的转基因小鼠中观察到寿命延长与肿瘤发生率下降，表明这类机制具有跨物种可移植性 ^[4]。换言之，序列完整性与特定生物学表型之间的因果链，迄今尚未完全打通。

本工作报道了一组二倍体、分单倍型解析、从端粒到端粒的裸鼹形鼠基因组组装，并辅以23个组织的转录组注释。该组装解析了无卫星序列的着丝粒、Y染色体，以及15号染色体上一段约25 Mb的结构多态性区域；作为对比，作者同时对寿命较短的独居近缘种——开普沙丘鼹形鼠（Bathyergus suillus）——构建了长读长主组装，把裸鼹形鼠的"非常规"特征置于系统发育背景下加以考察。

比较基因组分析揭示了几类与裸鼹形鼠独特性状相关的序列事件：包括若干与精子活力—生育力解耦相关的基因丢失，例如Irgc；以及与免疫、繁殖、基因组稳定性相关的基因扩增，其中错配修复MutL同源基因Pms1出现多达六个拷贝。这些资源为后续在特定位点上开展功能研究、直接检验寿命延长、肿瘤抑制与生殖策略的遗传基础，提供了此前不具备的完整参考。

不过，组装与注释的完成并不等于机制的阐明。例如本工作识别出的基因丢失（如Irgc）与扩增（如六个Pms1拷贝）尚需在功能实验中加以验证；而高分子量透明质酸与肿瘤抑制之间的因果关系 ^[3]，以及Has2转基因小鼠所呈现的延寿效应 ^[4] 是否能完全由本组装所揭示的序列变异来解释，仍有待进一步研究。