ADT：用于 3D 分子结构的全原子扩散分词器

ADT（All-atom Diffusion Tokenizer）是一种面向 3D 分子结构的全原子扩散分词器，通过将分词粒度与重建分辨率解耦，在紧凑离散表征下实现全原子重建。其对小分子采用逐原子分词、对蛋白质残基使用同时编码主链与侧链几何的单一 token，并借助扩散模型恢复分词造成的几何失真。实验显示 ADT 支持高质量自回归生成小分子与全原子蛋白结构。