bioRxiv Genomics· Malik, T., Berlind, J., Khan, A., van Nimwegen, B., Acman, M., Amin, N. D. ·· 4 天前精选评分57
BOB-seq v0.1:使用生物正交条形码进行RNA异构体分辨的多重测序
RNA isoform-resolved multiplexed sequencing with bioorthogonal barcoding
导读
研究人员开发了BOB-seq v0.1方法,通过酰化和点击化学将生物正交条形码直接连接到细胞RNA的多个内部位置。在物种混合实验中,逆转录酶从RNA模板切换到其连接的条形码准确率超过99%。该方法无需文库片段化步骤,可通过poly(dT)或随机六聚体引物选择3'末端计数或全长异构体捕获。药物筛选实验显示该方法能识别全转录组范围内的靶向和非靶向RNA剪接效应。
推荐理由
该方法通过生物正交条形码直接标记RNA内部多位点,在物种混合实验中实现了超过99%的模板转换准确率。
来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org