多祖源转录组关联研究为乳腺癌风险锁定 290 个候选易感基因
多祖源转录组关联研究:为乳腺癌风险锁定290个候选易感基因
一项覆盖非洲、亚洲、欧洲三大祖源人群的转录组关联研究,用 652 份正常乳腺组织构建基因调控预测模型,在 178,534 例乳腺癌与 248,300 例对照的 GWAS 数据中锁定 290 个乳腺癌风险相关基因,其中 103 个为既往 TWAS 未报道、46 个远离已知 GWAS 位点。
发生了什么
一项覆盖非洲、亚洲、欧洲三大祖源的转录组关联研究(TWAS),先用652份正常乳腺组织构建基因调控预测模型,再套用到178,534例乳腺癌病例和248,300例对照的GWAS数据上,锁定290个与乳腺癌风险显著相关的基因,其中103个是既往TWAS从未报道的,46个距已知GWAS风险位点至少500Kb[1]。研究在表达量之外还纳入可变剪接和3′UTR可变多聚腺苷酸化两个层面,并用CRISPR敲除、siRNA敲低和单细胞测序为其中169个基因补上了功能证据。
为什么重要
这项工作回答的是GWAS研究里长期卡住的一环:信号在位点上,但驱动风险的具体基因是谁。它把位点翻译成了基因名单,而且46个远离已知位点的基因说明只盯着已发现区域做定位会漏掉一批候选;这些基因还富集在与乳腺癌发生相关的通路上[2]。方法上,把表达量、剪接、多聚腺苷酸化放进同一框架,再用基因组编辑和单细胞测序做功能闭环,这套流程可迁移到其他复杂疾病;三大祖源的设计也让结论不限于单一人群,对做靶点发现和早期研发的人是一份现成的候选清单。
还缺什么
材料没有给出290个基因的完整清单、各基因的效应大小,也没有披露祖源之间哪些信号共享、哪些特异,169个基因的功能验证具体表型结果同样要读原文才知道。下一步看这些候选里有多少与现有乳腺癌药物靶点或在研管线重合、哪些值得进入靶点确证。发表时间线待确认:材料标注2026年10月,而同行评审记录中同时存在2025年与2026年的版本信息,最终期刊与版本待确认。
- 1.Multi-Ancestry Transcriptome-wide Association Studies ... · pubmed.ncbi.nlm.nih.gov 2026
- 2.Multi-ancestry transcriptome-wide association studies uncover ... · pubmed.ncbi.nlm.nih.gov 2026
该研究在三大祖源人群中整合 TWAS、可变剪接与 APA 分析,并用 CRISPR 与 siRNA 为多数候选基因补上功能证据,读者可据此筛选值得深入研究的靶点。
来源:中文产业新闻 · mp.weixin.qq.com