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GEMS:将分子结构鉴定建模为同分异构体图上的学习搜索
GEMS: Molecular Structure Elucidation as Learned Search over Isomer Graphs
导读
GEMS 通过学习 2-switch 化学键编辑精炼候选结构以提升串联质谱小分子鉴定准确率,编辑过程保留分子式与原子价态。在 NPLIB1 与 MassSpecGym 上 Hit@1/Hit@10 分别达 29.64%/50.81% 与 30.22%/41.33%,NPLIB1 端到端约 3.3 分钟,较 FRIGID 26.2 小时显著缩短;目标指纹预测误差被识别为靶标恢复的主要瓶颈。
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