解析酵母中表达的水熊虫 Dsup 蛋白对镉胁迫的细胞保护谱
Defining the spectrum of cellular protection against cadmium stress by Dsup expressed in yeast
研究人员在表达水熊虫 Dsup 蛋白的酵母中,对 4000 个基因敲除突变体施加三种剂量镉胁迫进行筛选,发现低剂量下 Dsup 广泛缓冲多个基因与细胞过程,高剂量下则转向保护特定基因与过程,识别出影响 Dsup 介导镉耐受性的宿主遗传通路。
缓步动物特有的Dsup蛋白源自对超强耐逆物种Ramazzottius varieornatus的基因组解析:这个内在无序的DNA结合蛋白在人培养细胞中可将X射线诱导的DNA损伤抑制约40%,并提高放射耐受性[3]。此后它被导入多种异源体系检验——在水稻中增强种子与幼苗的DNA损伤抗性、上调辐射与逆境相关基因表达[5];在烟草花粉中提升抗氧化水平以缓解UV-B伤害[6];但在大鼠皮层神经元中反而促进DNA双链断裂和神经毒性[4],提示其效应高度依赖宿主细胞环境。在胁迫一端,酵母应对镉等有毒金属的感应、解毒与耐受机制已有系统梳理[1],谷胱甘肽与硫氧还蛋白两大巯基氧化还原系统被证明是抗镉的核心[2]。然而Dsup抗辐射、抗氧化胁迫的证据虽多,它如何帮助细胞扛住镉这类其他胁迫,机制一直缺乏研究。
这项预印本工作针对的正是这一未解问题。作者团队此前在酵母中表达Dsup时发现,表达虽伴随适合度代价,却能提高细胞在包括重金属镉在内的多种胁迫下的存活率。为找出这种保护依赖哪些宿主遗传因素,他们在三个镉剂量下对表达Dsup的约4000个酵母基因缺失突变体进行筛选,以鉴定与Dsup协同乃至合成致死的基因和过程。结果呈现出清晰的剂量依赖格局:较低剂量镉胁迫下,Dsup对大量基因和过程的功能缺失起广泛的缓冲作用;剂量升高后,细胞转而依赖对特定基因和过程的缓冲。
这一结果把Dsup研究从“有没有保护”的表型描述,推进到“保护依赖什么”的遗传剖析:借助酵母缺失文库的系统筛选,作者鉴定出影响Dsup抗镉能力的宿主遗传过程,这与酵母镉耐受依赖多层解毒网络的既有认识[1,2]互为补充,也与Dsup在不同细胞环境中效应迥异的观察[4]相呼应——Dsup的保护力并非蛋白质的孤立属性,而是与宿主基因型互作、并随胁迫强度重塑的结果。
当然,仅就摘要而言,被缓冲基因的具体名单与分子机制尚不可见;Dsup为何在低镉下呈广谱缓冲、高镉下转为特异缓冲仍待解释;表达的适合度代价如何与保护收益权衡,以及这些来自酵母的结论能否推广到其他生物,也都是悬而未决的问题。
- 1.How Saccharomyces cerevisiae copes with toxic metals and metalloids · FEMS Microbiol Rev 2010
- 2.A proteome analysis of the cadmium response in Saccharomyces cerevisiae · J Biol Chem 2001
- 3.Extremotolerant tardigrade genome and improved radiotolerance of human cultured cells by tardigrade-unique protein · Nat Commun 2016
- 4.The Tardigrade damage suppressor protein Dsup promotes DNA damage in neurons · Mol Cell Neurosci 2023
- 5.The Dsup coordinates grain development and abiotic stress in rice · Plant Physiol Biochem 2023
- 6.Mitigation of UV-B Radiation Stress in Tobacco Pollen by Expression of the Tardigrade Damage Suppressor Protein (Dsup) · Cells 2024
来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org