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生成式检索做反向靶点钓鱼:GenFish 与首个蛋白质组规模基准 ProTargetBench
Generative Retrieval for Reverse Target Fishing with a Proteome-Scale Benchmark
导读
研究团队提出 GenFish 生成式检索模型做反向靶点钓鱼,用残差向量量化把蛋白质语言模型特征转为共享语义标识符,避免把未记录配对误标为负样本。配套发布首个蛋白质组规模基准 ProTargetBench,覆盖 20,431 个人类蛋白,在 198 个留出分子上三项全目录检索指标均优于 7 个基线方法。Pfam 比对显示语义标识符可捕获蛋白间生物学关联。
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