bioRxiv Genomics· Modolo, E., Patel, L., Ram, O., Simon, I., Mendenhall, E., Heinz, S., Benner, C., Goren, A. ·· 6 天前精选评分54
ChIP-seq 与 CUT&Tag 组蛋白标记谱差异由 GC 含量和染色质可及性解释
Discrepancies between ChIP-seq and CUT&Tag histone mark profiles are explained by GC content and chromatin accessibility
导读
预印本研究系统比较 ChIP-seq 和 CUT&Tag 在 K562 和 MCF-7 细胞系中多种组蛋白标记的检测差异。分析表明 CUT&Tag 在低 GC 区域灵敏度有限，而在高可及性染色质中信号增强；在活性基因体和 Polycomb 抑制域中分别丢失 H3K36me3 和 H3K27me3 信号。启动子区域差异与 GC 含量和染色质可及性系统相关。
来源：bioRxiv Genomics · biorxiv.org