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原文
bioRxiv Genomics· Zhang, A., Tasaki, S., Connell, D., Ng, B., Gaiteri, C. ·· 4 天前精选评分57

深度学习基因表达预测模型的疾病相关性与可复现性评估

Disease relevance and replicability of deep learning gene expression prediction

导读

该预印本质疑深度学习从 DNA 序列预测基因表达水平的模型在疾病研究中的价值。模型整体表现高主要来自区分基因开与关,对已表达基因的疾病相关表达变化预测能力有限;基因表达分布越呈双峰,报告性能越好。作者还发现已发表代码与报告性能之间存在不一致,强调版本管理和公开评估代码的必要性。

推荐理由

对常被引用的高表现指标做了疾病语境的复现检验,结果说明这些模型对组学预测的实际贡献有限。

来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org