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中文产业新闻· 生物探索·· 2026-08-19评分60

《Nature Biotechnology》蛋白组学研究识别潜在CRBN互作组,或为下一代分子胶提供起点靶点

Nature Biotechnology | 那些“没有被降解”的蛋白,可能才是下一批分子胶靶点

导读

生物探索报道,《Nature Biotechnology》发表Proteome-wide identification of the druggable CRBN interactome研究,提出换一种提问角度,不直接找已被降解的蛋白,而是先筛与CRBN已有弱结合的蛋白。研究在人蛋白质组中识别出一个被低估的潜在CRBN互作组,涵盖锌指蛋白等不同蛋白家族,或可作为下一代分子胶药物的起点。

深度解读

分子胶降解剂通过诱导靶蛋白、小分子与E3连接酶组分形成三元复合物,经泛素-蛋白酶体系统清除目标,并能对付传统上“不可成药”的蛋白 [2];含戊二酰亚胺骨架的CRBN分子胶已获批用于多发性骨髓瘤和急性髓系白血病 [4]。但新分子胶的发现长期带有偶然色彩 [2],至今主要依赖各类筛选 [5],理性设计仍然困难,因此领域一直在寻找无偏见的发现方法 [3]。已有的策略,无论是低NEDD8化细胞中的化学筛选加多组学解析 [2]、在患者来源癌细胞系上筛选CRBN配体库 [5],还是用活性受损的CRBN-DDB1ΔB在裂解液中做高通量亲和蛋白质组 [3],读出逻辑都以“配体已能招募、蛋白已被降解”为中心,那些能与CRBN结合却尚未被降解的蛋白,很难进入视野。

《Nature Biotechnology》近日发表的 "Proteome-wide identification of the druggable CRBN interactome" 恰恰把问题倒过来问:与其只找“已经被降解的蛋白”,为什么不先找那些已经能与CRBN弱结合、却还没有被降解的蛋白。沿这条线索,研究者在人蛋白质组中描绘出一个此前被低估的“潜在CRBN互作组”(latent CRBN interactome),其覆盖范围从锌指蛋白一直延伸到结构完全不同的蛋白家族。作者提出,这些微弱的相互作用或许正是下一代分子胶药物的起点。

这一工作与近年同类研究形成互补。基于CRBN-DDB1ΔB的亲和蛋白质组曾绘制配体诱导的CRBN结合景观,报告了298个蛋白靶标,并为非锌指蛋白PPIL4找到先导化合物 [3];细胞系筛选也已把可降解靶点拓展到CK1α、IKZF1/3等 [5]。相比之下,新研究把“能与CRBN弱结合但尚未被降解”本身视为可成药的信号,把搜寻的起点从降解表型前移到互作层面,从而把候选靶点池从经典的锌指类新底物扩展到结构迥异的蛋白家族,为分子胶发现提供了一个新的入口。

当然,弱结合只是故事的开始。消息并未说明这些相互作用将如何被转化为可诱导降解的化学起点;而即便降解得以实现,也只算跨过第一道门槛——高效降解剂还需要快速降解、高活性、高最大降解度(Dmax)以及不重复给药下的持久靶点清除 [1],这些都仍有待逐例验证。

来源:中文产业新闻 · mp.weixin.qq.com