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AI × 生物医药· arXiv · cs.AI·· 2 小时前精选评分49

推理时投影恢复 Boltz-2、OpenFold-3 共折叠输出的物理有效性

Inference-Time Projection for Physically Valid Biomolecular Diffusion Models

导读

作者提出两种闭式推理时投影算子,分别处理 AF3 类扩散模型共折叠输出中的链间冲突与配体几何畸变,在 Boltz-2 与 OpenFold-3 上无需重训或梯度计算即可恢复完美物理有效性。方法经 CASP15、CASP16、PoseBusters 单体与复合物集及 Boltz 物理有效性测试集验证,结构精度与配体放置指标不受影响,运行时与显存开销可忽略。

来源:AI × 生物医药 · arxiv.org

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