CRISPR-Cas12a 编辑曼氏血吸虫卵实现稳定染色体整合
Toward transgenic multicellular parasites: CRISPR-Cas12a germline editing of Schistosoma mansoni eggs as key to success.
研究者在曼氏血吸虫中用 CRISPR-Cas12a 对卵细胞系进行 RNP 编辑,在 GSH1 安全港位点实现同源定向插入并获得染色体水平的稳定整合与跨代遗传。以 EGFP 为报告基因、由曼氏血吸虫 ubiquitin 启动子驱动,电转肝源卵后经螺类与仓鼠感染循环均可观察到 EGFP 阳性成虫;同一流程下 Cas9 编辑效率低于 Cas12a。DOI: 10.1126/sciadv.aeh0455
血吸虫病在全球累及两亿余人,曼氏血吸虫基因组早已完成测序[2],转录组也系统刻画了生活史各阶段的表达动态[4],但稳定遗传操作手段一直缺位。CRISPR-Cas虽以简便可编程的RNA引导靶向切割革新了众多物种的基因组编辑[1,3],其同源定向修复路径却普遍受制于低效率[6];在血吸虫研究中,编辑虽已在其螺类中间宿主建立,寄生虫本体仍止步于虫卵层面的编辑——此前用三条重叠gRNA联合Cas9虽可将供体整合推高至70%,却依赖多重gRNA,而建立稳定转基因品系按作者所述在该领域始终未能实现。致病核心恰是沉积于宿主组织的虫卵,雌虫卵巢与卵细胞分化的分子基础近年才由单细胞转录组初步揭示[5],这使得针对生殖系的操作更显迫切。
本文以实验感染啮齿类肝脏中的虫卵为底物——卵群发育阶段异质,整合事件有望传入下一代——经电穿孔递送CRISPR,系统比较识别NGG的SpCas9与识别富T PAM的AsCas12a对安全港GSH1(AT含量65.82%)的编辑。作者先从转录组数据锁定组成性表达的泛素基因Sm ubi,以其启动子和终止子驱动EGFP;供体采用5′端C6-PEG10修饰、含50 nt同源臂的dsDNA,并把供体内PAM由TTTC改为TCTC以防被再切割。TIDE测得编辑率Cas9为2.2±0.9%、Cas12a为3.0±0.9%,而深度测序显示Cas12a效率高出约百倍,缺失长9–18 nt(Cas9仅1 nt);egfp整合拷贝数亦显著更高(约10 ng DNA中7235±0.458对6594±0.196)。转染后第5天,Cas12a组43.6±19.9%的虫卵内毛蚴呈EGFP阳性,高于Cas9组的20.2±10.1%。
在此基础上,作者以两条路线把编辑产物接回生活史。“生物学”路线中,约5%的螺逸出携带GSH1编程编辑的尾蚴,回收成虫虽不表达EGFP,却在预测切割位点带9 nt缺失,表明indel可随生活史稳定传递。“外科”路线依托可体外培养逾28天的胞蚴,将荧光富集的转基因胞蚴移植入螺,同样约5%逸蚴,其中一粒螺的尾蚴经PCR确认为阳性;以其感染仓鼠回收的322条雌虫全部EGFP阳性且荧光见于卵巢,提示经生殖系传递。单毛蚴感染的185粒螺中6.7%逸蚴,约三分之一尾蚴携带报告基因,雌雄成虫乃至F1代均保持EGFP表达。这证明可在胞蚴阶段依据报告基因富集转基因虫体——该阶段虽是螺内传播放大的关键环节,其发育机制的认识仍属薄弱[7]。
局限同样清楚:5′整合位点精度波动明显(比对率73.4±26%,3′侧为94.6±5.2%);外科路线仅一粒螺产出转基因尾蚴,且对照螺因不明原因无一逸蚴;电穿孔还可能影响毛蚴的运动与感染力。如何高效、可重复地获得种系整合品系,仍是迈向可遗传转基因血吸虫的下一步难题。
- 1.The next generation of CRISPR-Cas technologies and applications · Nat Rev Mol Cell Biol 2019
- 2.The genome of the blood fluke Schistosoma mansoni · Nature 2009
- 3.Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems · Science 2013
- 4.A systematically improved high quality genome and transcriptome of the human blood fluke Schistosoma mansoni · PLoS Negl Trop Dis 2012
- 5.The retinoic acid family-like nuclear receptor SmRAR identified by single-cell transcriptomics of ovarian cells controls oocyte differentiation in Schistosoma mansoni · Nucleic Acids Res 2025
- 6.Efficient high-precision homology-directed repair-dependent genome editing by HDRobust · Nat Methods 2023
- 7.Single-cell transcriptomics of the human parasite Schistosoma mansoni first intra-molluscan stage reveals tentative tegumental and stem-cell regulators · Sci Rep 2024
为长期缺乏转基因工具的曼氏血吸虫提供了 Cas12a 介导的染色体稳定整合方案,可作为其他扁形动物功能基因组学研究的参考。
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