bioRxiv Genomics· van Vliet, A. H. M. ·· 2 天前精选评分40
基于全基因组与注释的荚膜组织胞浆菌快速多位点序列分型方法
Rapid whole genome- and annotation-based multilocus sequence typing of the fungal pathogen Histoplasma capsulatum
导读
研究人员开发了针对WHO高优先级真菌病原体荚膜组织胞浆菌(H. capsulatum)的快速全基因组多位点序列分型(MLST)方案。基于406个公共基因组组装构建了wgMLST、annMLST与fanMLST三种方案，每种含超过8,000个标记，可在常规计算设备上重现区分全部7个谱系及6个南美亚谱系，方案间比较的r²值在0.8–1.0之间。
来源：bioRxiv Genomics · biorxiv.org