AnnZarro：面向单细胞矩阵可视化的浏览器查看器教程
Dysregulation of epithelial differentiation architecture underlies field cancerization in head and neck cancer
AnnZarro 是一款点选式浏览器查看器，将 cell-by-cell 与 gene-by-gene 矩阵与 AnnData 对象的 cells × genes 数据联动呈现，供实验生物学家无代码探索数据。
发生了什么
该预印本发布了 AnnZarro，一个基于浏览器的点击式交互查看器，用于可视化单细胞数据中的细胞×细胞与基因×基因矩阵（如内核、相关性），并将其与 AnnData 对象的细胞×基因数据联动。工具仅从 zarr 存储读取面板所需的行列，支持远超内存的数据集：在笔记本上 100,000 细胞子集 4 秒打开并保持交互，关闭子集模式下 95.6 million 细胞约 5 到 7 秒绘制完成。预印本提供六个演示示例，包含 Kompot 差异丰度/表达、扩散内核与基因相关性。doi 为 10.64898/2026.10.12.757511，资助包括 NIH 多项资助（R01-AR070780、R35-GM147125 等）及 Andy Hill CARE Fund、American Cancer Society 等。
为什么重要
解决了单细胞分析中核心矩阵关系缺乏直接可视化工具的痛点，让实验生物学家无需编码即可探索，计算生物学家能直观审视分析背后的细胞/基因关系。其分块读取 zarr 的架构使大规模数据在普通硬件上可交互，降低了大规模单细胞图谱的探索门槛，对构建、质控及解读百万级细胞图谱的团队具有即时实用价值。
还缺什么
尚处于预印本阶段，同行评审状态待确认；工具在除演示数据集外的其他模态、物种、空间组学数据上的鲁棒性与生物学发现验证案例待后续报告；社区采纳度、插件生态及与主流工作流的集成深度仍需观察。
来源：bioRxiv Cancer Biology · biorxiv.org