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原文
bioRxiv Genomics· Whitt, L., Akozbek, L., Bentz, P. C., Armstrong, E., Harkess, A., Carey, S. B. ·· 4 天前精选评分40

CBS-tools:用于基因组组装中性染色体的识别、分相与结构注释

Identifying, phasing, and structurally annotating sex chromosomes for genome assemblies using CBS-tools

导读

CBS-tools 是一款基于 k-mer 的分析工具,可通过少量已知性别个体的全基因组测序数据,预测异配性别、校正性染色体分相并划定性决定区域(SDR)边界。在 31 个公开数据集的测试中,该工具正确识别了所有物种的已知性染色体系统,并提供交互式网页平台用于 SDR 边界可视化。CBS-tools 既适用于此前未被研究过的性染色体系统,也可用于已有充分研究的性染色体对。

来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org