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原文
bioRxiv Genomics· Kang, C., Ningappa, M., Higgs,, B. W., Gestrich, C., Mazariegos, G., Ashokkumar, C., Schmitt, L., Ranganathan, S., Subramaniam, S., Sindhi, R. ·· 13 天前评分32

儿童终末期肝病与移植后免疫结局的空间分子图谱

Spatial landscape of pretransplant liver disease and post-transplant immune outcomes in children

导读

研究利用 CosMx 空间转录组平台对 98 例儿童肝组织样本(约 500 万个细胞)进行 1K 和 6K RNA 面板分析,疾病涵盖胆道闭锁、PFIC、肝母细胞瘤、急性肝衰竭及妊娠同种免疫性肝病等终末期病变,以及移植后急/慢性排斥和免疫抑制剂撤停活检。

深度解读

儿童肝移植自上世纪八十年代广泛应用以来,已是终末期肝病患儿唯一确定性的治疗手段,但供体器官稀缺、手术技术复杂以及长期并发症的防控,使这一领域始终充满挑战[1]。数十年来,证据主要来自临床结局研究:单中心569例儿童肝移植的13年经验确立了移植前因素与患者及移植物生存的关联[1];针对最主要适应证胆道闭锁,SPLIT登记755例患儿的分析显示移植后3年生存率为88%,死亡多源于感染,风险因素以非手术性为主[2];另一中心280例胆道闭锁患儿的10年随访报告1、5、10年患者生存率分别为85%、82%与82%[3]。相比之下,分子层面的认识明显滞后:原发硬化性胆管炎已有以供肝为对照、采用单细胞与空间转录组的肝脏免疫图谱[4],而横跨多种儿童终末期肝病诊断、并延伸到移植后免疫结局的空间分子数据仍属少见。

这项发布于bioRxiv的预印本提供了此类数据。作者使用CosMx 1K与6K两套RNA panel对98份肝组织样本进行空间转录组分析,累计约五百万个细胞表达谱。样本设计兼顾移植前后:既有作为参照的供肝组织,也覆盖胆道闭锁、进行性家族性肝内胆汁淤积、肝母细胞瘤、急性肝衰竭与妊娠同种免疫性肝病等终末期疾病;移植后活检则横跨无排斥、T细胞介导排斥、抗体介导排斥、混合病理,以及免疫抑制撤药研究的不同结局组。初步探索性分析比较了各临床队列的细胞组成与基因丰度及变异度。

最引人注目的发现是一个由变异度最高的基因组成的十二基因特征:急性期反应基因(如SAA1)与促纤维化基因(如COL1A1)在这些病因迥异的疾病间形成共同纽带,提示一条共享的损伤—修复—重塑基因网络。相比以PSC为主的图谱研究[4],本研究将多种儿童终末期肝病与移植后免疫病理纳入同一空间分析框架,使移植前疾病背景与移植后免疫结局得以并置比较;这也接续了该团队2025年2月关于移植排斥中记忆细胞启动与空间分化网络的预印本工作[5],把视角从排斥反应扩展到移植前疾病谱。

需要指出的是,作者将现有结果定位为初步探索性分析,十二基因网络的临床与因果意义尚未确立;作者自己也认为,需借助更高分辨率、分区特异性的空间作图来阐明发病机制。同期已有研究将Visium HD应用于三名健康供肝样本(两名成人、一名儿童)[6],提示这类高分辨率平台正是后续验证可以借力的技术路径。

来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org