bioRxiv Genomics· Stritt, C., Loiseau, C., Kalkan, S., Borrell, S., Brites, D., Gagneux, S. ·· 4 天前精选评分50
结核分枝杆菌复合群中插入序列 IS6110 的演化动态研究
Evolutionary dynamics of the insertion sequence IS6110 in the Mycobacterium tuberculosis complex
导读
Stritt 等在 bioRxiv 预印本研究 10,000 株结核分枝杆菌复合群(MTBC)中插入序列 IS6110 的演化动态,开发了无需参考基因组即可从短读长数据中检测 IS 插入位点的工具,并用祖先状态重建推断拷贝数(1 至 30 以上,La3/M. orygis 最高)与插入出生率。
推荐理由
提供了一个不依赖参考基因组即可从短读长数据中检测 IS 插入的工具,可迁移到其他原核生物的转座元件分析。
来源:bioRxiv Genomics · biorxiv.org