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ecCLIP与Pythia构建高分辨率RBP-RNA结合图谱
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事件综述
2026年10月13日,bioRxiv发表ecCLIP与Pythia相关预印本。研究团队在HEK293T细胞中对67个内源标签RBP进行ecCLIP实验,获得均一的高分辨率CLIP-seq结合图谱,并据此训练了结构感知神经网络Pythia,从序列与结构预测RBP结合。研究者另在5个RBP上用MPRC验证了序列/结构分解效果。此外,将ecCLIP数据加入Borzoi衍生模型Borzuki后,RNA半衰期预测与3′UTR变异效应评估均得到改善。
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最新进展10月13日 08:00
2026年10月13日,bioRxiv发表ecCLIP与Pythia,构建高分辨率RBP-RNA结合图谱并实现结构感知预测。报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月13日
- bioRxiv Genomics精选ecCLIP 与 Pythia 联合构建 RBP-RNA 高分辨率结合图谱并实现结构感知预测
作者在 HEK293T 中用 ecCLIP 对 67 个内源标签 RBP 做出均一高分辨率 CLIP-seq 结合图谱,并据此训练结构感知神经网络 Pythia 从序列与结构预测 RBP 结合;用 MPRC 在 5 个 RBP 上验证了序列/结构分解,把 ecCLIP 加入 Borzoi 衍生模型 Borzuki 后改善了 RNA 半衰期预测与 3′UTR 变异效应评估。
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