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MERFISH无扩增池化遗传筛选解析肝组织细胞互作
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事件综述
研究人员报道一种基于无扩增 MERFISH 的成像池化遗传筛选方法。该方法通过直接杂交将扰动条码回收效率提高约 10 倍，内源转录本检测灵敏度提高 2.5 倍。研究团队构建靶向约 200 个肝细胞基因的遗传嵌合小鼠肝脏，在完整组织中对 150 万细胞进行成像分析，并在单细胞分辨率下记录到两类细胞非自主表型：V-ATPase 功能受损肝细胞周围出现 pDC 样细胞局部聚集；Vhl 扰动肝细胞邻近血管细胞呈现缺氧激活的血管生成反应。该工作将成像型池化筛选从培养细胞或解离样本拓展到完整组织层面的细胞间互作分析。
由模型根据报道生成 · 3 小时前更新
最新进展10月6日 08:00
该方法在完整肝组织中鉴定出 V-ATPase 与 Vhl 扰动引发的两类细胞非自主表型。报道时间线
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10月6日
- bioRxiv GenomicsMERFISH 池化遗传筛选在完整肝组织中揭示细胞非自主表型
作者报道一种基于无扩增 MERFISH 的成像池化遗传筛选方法，直接杂交下把扰动条码回收提高约 10 倍、内源转录本检测提高 2.5 倍。该方法用于靶向约 200 个肝细胞基因的遗传嵌合小鼠肝脏，在完整组织中分析 1.5 百万细胞，同时记录到 V-ATPase 功能受损肝细胞附近 pDC 样细胞局部聚集，以及 Vhl 扰动肝细胞邻近血管细胞的缺氧激活血管生成反应。
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