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DeepND解析核小体DNA序列语法与癌症突变及甲基化景观
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事件综述
2026年10月4日,bioRxiv预印本报道了DeepND框架——一种可解释的深度学习工具,可区分核小体与核小体间DNA,并鉴定出210个长度为2–16 bp的核小体相关序列motif。其中44个motif呈癌种特异的体细胞突变富集或缺失,6个与差异DNA甲基化相关。在肺癌和子宫内膜癌中,突变沿不同小沟朝向呈约10 bp周期性富集,提示核小体旋转定位影响突变与DNA修复过程。该工作为理解核小体DNA序列语法如何塑造癌症突变与表观遗传景观提供了系统框架。
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最新进展10月4日 08:00
DeepND框架鉴定210个核小体相关motif,44个与癌种特异突变相关,6个与差异甲基化相关。报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月4日
- bioRxiv Genomics精选DeepND 解析核小体与连接 DNA 序列语法对癌症突变和甲基化图谱的塑造
DeepND 是一个可解释的深度学习框架,可区分核小体与核小体间 DNA,并鉴定 210 个长度为 2-16 bp 的核小体相关序列 motif。其中 44 个 motif 呈癌种特异的体细胞突变富集或缺失,6 个与差异 DNA 甲基化相关。在肺癌和子宫内膜癌中,突变沿不同小沟朝向呈约 10 bp 周期性富集,提示核小体旋转定位影响突变与 DNA 修复过程。
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