PhyloThin方法揭示原核基因组采样偏倚

2026年10月5日，bioRxiv Genomics发表研究，报告研究人员开发了PhyloThin方法，用于检测并降低原核生物基因组数据集中的采样偏倚。该方法基于系统发育关系评估采样代表性，而非单纯依赖基因组数量作为衡量标准。研究团队在NCBI数据库中的402个物种上进行了测试，结果显示这些物种的有效样本量比实际样本量低41%，表明基因组数据集中存在显著的过度采样问题。PhyloThin方法进一步揭示，不同物种的过采样程度存在显著差异，说明仅凭基因组数量并不能准确衡量物种表征的充分性。在对偏倚进行校正后，研究人员观察到更多尚未被鉴定的基因以及更高的基因组多样性。研究指出，这一发现对病原体监测和新基因功能发现具有积极意义，有助于更准确地评估原核生物基因组数据的代表性和多样性。由于该事件目前仅有一篇报道，尚未出现早先与后续报道之间的矛盾或补充。

由模型根据报道生成 · 1 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。