CSHL 访谈 Charlotte Bunne：生物基础模型与虚拟细胞愿景

CSHL Leading Strand 邀请 Charlotte Bunne 讲生物基础模型（biological foundation models）与"虚拟细胞"愿景——用跨模态、跨批次的单细胞数据训练可迁移的表征。

• 模态专属编码（modality-specific）：强调不同数据类型（转录组、蛋白、图像）应先用各自编码器映射，再在对齐空间融合，而非强行拼入同一原始空间——比"全塞进一个 transformer"更稳。
• 免 Scanorama 的多模态整合：提出不依赖 Scanorama 等传统批次校正工具、直接由模型学习跨数据集 / 跨模态对齐的方案，减少手工预处理带来的偏差。
• 虚拟细胞（virtual cell）：目标是在统一表征上做细胞状态预测、扰动响应模拟，作为"in silico 实验"平台，加速靶点发现与机制假设。
• 定位与边界：单细胞 ML / 虚拟细胞，