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Science论文:冷冻电镜断层成像揭示人类核糖体前体的核仁内原位成熟路径

Science|核仁内“目击”核糖体装配:冷冻电镜断层成像揭示人类核糖体前体的原位成熟路径

导读

一篇发表于 Science 的研究用冷冻电镜断层成像在人类细胞核仁内直接观察了核糖体前体的装配过程,揭示其原位成熟路径。此前对核糖体装配中间体的高分辨率认识主要来自细胞外纯化样品的单颗粒结构,无法提供装配过程在真实细胞空间中的位置与动态信息。

深度解读

核糖体生物发生起始于核仁:rRNA 在此转录加工,与核糖体蛋白及大量装配因子逐步结合,形成前体颗粒 [5]。过去二十余年里,研究者通过生化分级分离已为两条亚基装配路径勾勒出"组分变化地图"——60S 前体从核仁到细胞质,约 50 种非核糖体蛋白先结合后陆续解离 [2];90S 到 40S 的成熟则涉及约 30 种因子的更替 [3]。冷冻电镜单颗粒技术的兴起进一步提供了不同前体的伪原子级结构,揭示了 rRNA 逐步折叠与装配因子结合的方式 [5]。然而这些认识大多来自离体纯化样品 [4],装配过程在真实核仁空间中的位置与动态一直无法直接观察。与此同时,核仁被理解为多层液-液相分离凝聚体 [1],其内部相区与前体成熟的时空对应关系在分子层面仍是空白。

这条报道的 Science 研究正是针对这一缺口,利用冷冻电镜断层成像(cryo-ET)在 HeLa 细胞核仁内"目击"了人类核糖体前体的原位成熟过程 [6]。研究者通过冷冻关联光电镜断层技术,在同一细胞环境中获得了 SSU 过程体与 pre-60S 两类亚基前体的原位结构快照 [6],把此前需要纯化才能看清的分子细节放回到核仁的真实空间坐标中。

相对于已有认识,这项工作的推进在于将"分子组成"与"空间位置"合到同一张图上。过去的生化分级分离描绘了因子"何时"出现与消失 [2, 3],单颗粒冷冻电镜揭示了"长什么样" [5],而本工作进一步呈现了"在核仁什么位置、呈现何种形态"。值得一提的是,同期在莱茵衣藻中开展的冷冻断层成像研究也观察到核糖体生物发生的梯度式组织 [7],与本工作相互印证。

局限同样明显。纯化样品的单颗粒冷冻电镜目前已能将早期 60S 中间体解析到 3.3–4.5 Å 并定位 25 种装配因子的 6 种构象 [8],或将人源核内 pre-60S 的 11 个状态解析到 2.8–4.3 Å [9],分辨率仍远高于原位断层成像。"原位定位"与"高分辨细节"之间如何取得平衡,以及核仁不同相区如何与前体折叠耦合,仍是有待回答的问题。

推荐理由

用冷冻电镜断层成像在核仁内直接观察核糖体前体装配,补充了以往细胞外纯化样品所缺失的空间与时序维度。

来源:中文产业新闻 · mp.weixin.qq.com

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