bioRxiv Genomics· Reinuss, H., Goldberger, J., Kalisky, T. ·· 7 天前精选评分42
肾脏类器官单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的稳健性评估
Robustness measures for cell type classification in single-cell RNA-seq datasets of kidney organoids
导读
研究提出了两种互补的稳健性指标——分类稳定性评分和预测特异性评分,用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型标签转移算法的可靠性。在人类胎儿肾脏和四种iPSC来源的肾脏类器官数据集上的应用显示,人类胎儿肾脏大多数细胞类型稳健性评分较高,而类器官中上皮谱系的评分则因分化方案不同而异。模拟细胞移除实验验证了该指标能正确识别不可靠的分类。
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