中文产业新闻(药渡 / pharmcube)· BioArt·· 6 小时前精选评分60
Cell论文提出State方法,可不依赖大规模单细胞扰动实验预测细胞跨语境扰动响应
Cell丨打破单细胞扰动实验高成本限制,利用State预测跨不同语境的细胞对扰动的响应
导读
单细胞CRISPR筛选等功能基因组学技术虽能在特定细胞语境下实现转录组级别读出,但成本高昂使其难以跨多种语境拓展;现有深度学习模型在跨语境泛化扰动效应时效果也常难以超越简单线性模型。Cell发表的方法State尝试利用已有数据预测细胞对扰动的跨语境响应,以降低对大规模扰动实验的依赖。
推荐理由
文章指出单细胞扰动实验成本高且现有深度学习模型跨语境泛化能力有限,State方法尝试用计算替代部分实验以降低功能基因组学研究门槛。
来源:中文产业新闻(药渡 / pharmcube) · bydrug.pharmcube.com