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Chowdhury 在 HHMI Janelia 研讨会上介绍基于逆散射的深层组织 3D 折射率成像方法
【AI4Science】逆散射计算生物成像:从 3D 折射率重建深层组织(Chowdhury, Janelia)
导读
HHMI Janelia 举办 AI4Science 研讨会,UT Austin 的 Shwetadwip Chowdhury 介绍用逆散射(inverse-scattering)方法从 2D 测量反演样本 3D 折射率,实现深层散射组织的无标记成像。
要点概括
HHMI Janelia 成像 Seminar——Shwetadwip Chowdhury(UT Austin,computational optics & waves lab)谈用逆散射(inverse-scattering)从 2D 测量反演样本 3D 折射率,从而无标记成像深层散射组织。
- 主线:传统光学仅清晰成像数十微米薄样本;深层组织因散射失明。其策略是反演样本 3D 折射率——折射率分布本身即散射校正后的无标记图像。
- 方法:multislice 将 3D 散射拆为逐层 2D 散射序列,求解病态逆问题;已展示斑马鱼胚胎、小鼠肾/胚胎切片、非洲爪蟾 200μm 厚组织的高对比重建(ER、脂滴、核结构可见)。
- AI:以“layer-by-layer 分解、体积积分或机器学习”求解;正探索用扩散模型(diffusion models)作正则项,以更少测量达成同等重建;同事报告扩散模型相关前期工作。
- 意义:有望推进厘米尺度、高散射组织的无标记形态与(未来)分子/高光谱成像。
- 定位:AI4Science(计算成像 + 机器学习 / 扩散模型正则化);Tier H;字幕。
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