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磁珠法纯化 NGS 文库 DNA(AMPure/SPRI beads)
导读
AMPure/SPRI 磁珠以羧基包被颗粒悬浮于 PEG/NaCl 溶液,借助 PEG 诱导核酸沉淀并以磁珠为成核点结合,可在 NGS 文库制备中实现纯化和片段大小选择。
要点概括
磁珠(常称 AMPure 或 SPRI beads)是羧基包被的磁性颗粒,悬浮在含 PEG 与氯化钠的溶液中;PEG/NaCl 让核酸从溶液里沉淀,并以磁珠为成核点结合,之后可用磁铁操控。
- 磁珠(常称 AMPure 或 SPRI beads)是羧基包被的磁性颗粒,悬浮在含 PEG 与氯化钠的溶液中;PEG/NaCl 让核酸从溶液里沉淀,并以磁珠为成核点结合,之后可用磁铁操控。
- 通过调节加入的 PEG 溶液比例,可以"调谐"结合不同大小的核酸,借此实现片段大小选择(size selection)。
- 标准流程:向样品中加入磁珠(溶液黏度高需缓慢吹打)→ 上下吹打或涡旋混匀(涡旋后离心收液)→ 室温孵育约 5 分钟,让核酸结合到珠面。
- 上磁架 2–5 分钟,待溶液澄清、磁珠贴到管壁背面后弃去上清(已不含样品);随后用 80% 乙醇洗两遍(每遍静置 30 秒,勿扰动磁珠 pellet),尽量吸净残乙醇。
- 室温干燥约 5 分钟至磁珠不再"发亮"(若出现干裂的褐色块状需立刻下架并洗脱);用洗脱缓冲液(水、低浓度 Tris 或 Tris-EDTA,不含高盐/PEG)重悬,30 秒后核酸重新进入溶液。
- 二次上磁更快(洗脱液不黏稠),吸出含纯化核酸的洗脱液即得干净样品;演讲者 Eric Chow(UCSF)全程在 Eppendorf 管与大磁架上演示该 NGS 建库纯化步骤。
- 定位:方法/NGS;非 AI。
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