多维显微数据集的存储、处理与可视化基础（Loïc Royer, CZ Biohub）

CZ Biohub 的 Loïc Royer 在图像分析课程中讲多维（3D + 时间 + 多通道）显微数据的基础：从显微镜采集、计算机存储到屏幕可视化的全流程，以及海量数据规模带来的存储/算力挑战。

• 现代显微镜越来越多产出 3D 乃至含时间、多通道的高维数据；3D 图称为 stack，由 voxel 组成（类比 2D 的 pixel）。
• 数据规模惊人：以果蝇胚胎 21 小时延时（30 秒间隔、约 2500 个 time point）为例，原始数据可达约 2 TB——对存储与算力提出挑战。
• 处理常在集群（cluster）上进行，涉及 3D 卷积、体渲染（volume rendering）、各向异性（z 轴分辨率常低于 xy）校正等算法。
• 压缩取舍：无损与有损（lossy）算法需在保真与体积间平衡；可视化端要做光照/衰减建模让 3D 体积可读。
• 定位：成像方法/生物图像分析基础（非 AI/deep learning）；Tier B 方法频道。